Baculites asperiformis

بیکٹیریل_کالونی_آپٹیمائزیشن/بیکٹیریل کالونی کی اصلاح:
بیکٹیریل کالونی آپٹیمائزیشن الگورتھم ایک اصلاحی الگورتھم ہے جو ایک لائف سائیکل ماڈل پر مبنی ہے جو E. کولی بیکٹیریا کے پورے لائف سائیکل کے دوران ان کے کچھ مخصوص طرز عمل کی تقلید کرتا ہے، بشمول chemotaxis، کمیونیکیشن، خاتمہ، پنروتپادن، اور ہجرت۔
بیکٹیریل کنجوگیشن/ بیکٹیریل کنجوجیشن:
بیکٹیریل کنجگیشن بیکٹیریل خلیات کے درمیان جینیاتی مواد کی منتقلی ہے جو براہ راست خلیے سے خلیے کے رابطے کے ذریعے یا دو خلیات کے درمیان ایک پل کی طرح رابطے کے ذریعے ہوتی ہے۔ یہ ایک pilus کے ذریعے ہوتا ہے. یہ بیکٹیریا میں تولید کا ایک پیرا سیکسول طریقہ ہے۔ یہ افقی جین کی منتقلی کا ایک طریقہ کار ہے جیسا کہ تبدیلی اور نقل مکانی ہے حالانکہ ان دو دیگر میکانزم میں خلیے سے خلیے کا رابطہ شامل نہیں ہوتا ہے۔ کلاسیکی ای کولی بیکٹیریل کنججیشن کو اکثر جنسی تولید یا ملاپ کے بیکٹیریل مساوی سمجھا جاتا ہے کیونکہ اس میں جینیاتی مواد کا تبادلہ۔ تاہم، یہ جنسی پنروتپادن نہیں ہے، کیونکہ گیمیٹ کا کوئی تبادلہ نہیں ہوتا ہے، اور درحقیقت کسی نئے جاندار کی کوئی نسل نہیں ہوتی ہے: اس کے بجائے ایک موجودہ جاندار تبدیل ہوتا ہے۔ کلاسیکی ای کولی کنجوجیشن کے دوران ڈونر سیل ایک کنجوگیٹیو یا متحرک جینیاتی عنصر فراہم کرتا ہے جو اکثر پلاسمڈ یا ٹرانسپوسن ہوتا ہے۔ زیادہ تر conjugative plasmids میں ایسے نظام ہوتے ہیں جو اس بات کو یقینی بناتے ہیں کہ وصول کنندہ سیل میں پہلے سے ہی ایک جیسا عنصر موجود نہ ہو۔ منتقل کی گئی جینیاتی معلومات اکثر وصول کنندہ کے لیے فائدہ مند ہوتی ہیں۔ فوائد میں اینٹی بائیوٹک مزاحمت، زینو بائیوٹک رواداری یا نئے میٹابولائٹس استعمال کرنے کی صلاحیت شامل ہوسکتی ہے۔ دوسرے عناصر نقصان دہ ہو سکتے ہیں اور انہیں بیکٹیریل پرجیویوں کے طور پر دیکھا جا سکتا ہے۔ Escherichia coli میں spontaneous zygogenesis کے ذریعے اور مائکوبیکٹیریم smegmatis میں تقسیم کنجوگل ٹرانسفر کے ذریعے جوڑنا بہتر مطالعہ شدہ کلاسیکی E. coli conjugation سے مختلف ہے کہ ان صورتوں میں والدین کے جینومز کا کافی ملاوٹ شامل ہے۔
بیکٹیریل_ڈسپلے/ بیکٹیریل ڈسپلے:
بیکٹیریل ڈسپلے (یا بیکٹیریا ڈسپلے یا بیکٹیریا کی سطح کا ڈسپلے) ایک پروٹین انجینئرنگ تکنیک ہے جو وٹرو پروٹین کے ارتقاء میں استعمال ہوتی ہے۔ بیکٹیریا کی سطح پر دکھائے جانے والے پولی پیپٹائڈس کی لائبریریوں کو فلو سائٹومیٹری یا تکراری انتخاب کے طریقہ کار (بائیوپیننگ) کا استعمال کرتے ہوئے اسکریننگ کیا جاسکتا ہے۔ یہ پروٹین انجینئرنگ تکنیک ہمیں پروٹین کے فنکشن کو اس جین کے ساتھ جوڑنے کی اجازت دیتی ہے جو اسے انکوڈ کرتا ہے۔ بیکٹیریل ڈسپلے کا استعمال مطلوبہ خصوصیات کے ساتھ ٹارگٹ پروٹینز کو تلاش کرنے کے لیے کیا جا سکتا ہے اور ان کا استعمال سیل کے لیے مخصوص ہونے والے وابستگی والے لیگنڈز بنانے کے لیے کیا جا سکتا ہے۔ اس نظام کو بہت سی ایپلی کیشنز میں استعمال کیا جا سکتا ہے جس میں نوول ویکسینز کی تخلیق، انزائم سبسٹریٹس کی شناخت اور اس کے ٹارگٹ پروٹین کے لیے ligand کی وابستگی تلاش کرنا شامل ہے۔ بیکٹیریل ڈسپلے اکثر میگنیٹک ایکٹیویٹڈ سیل سورٹنگ (MACS) یا فلوروسینس ایکٹیویٹڈ سیل سورٹنگ (FACS) تکنیکوں کے ساتھ جوڑا جاتا ہے۔ وٹرو میں پروٹین کے ارتقاء کے مسابقتی طریقے فیج ڈسپلے، رائبوزوم ڈسپلے، یسٹ ڈسپلے، اور mRNA ڈسپلے ہیں۔ بیکٹیریوفیج ڈسپلے سب سے عام قسم کا ڈسپلے سسٹم ہے جو استعمال کیا جاتا ہے حالانکہ بیکٹیریل ڈسپلے تیزی سے مقبول ہوتا جا رہا ہے کیونکہ تکنیکی چیلنجز پر قابو پا لیا جاتا ہے۔ FACS کے ساتھ مل کر بیکٹیریل ڈسپلے کا یہ فائدہ بھی ہے کہ یہ ایک حقیقی وقت کی تکنیک ہے۔
بیکٹیریل_ایفیکٹر_پروٹین/ بیکٹیریل انفیکٹر پروٹین:
بیکٹیریل اثر کرنے والے پروٹین ہوتے ہیں جو پیتھوجینک بیکٹیریا کے ذریعے اپنے میزبان کے خلیوں میں چھپتے ہیں، عام طور پر ٹائپ 3 سیکریشن سسٹم (TTSS/T3SS)، ٹائپ 4 سیکریشن سسٹم (TFSS/T4SS) یا ٹائپ VI سیکریشن سسٹم (T6SS) کا استعمال کرتے ہیں۔ کچھ بیکٹیریا اپنے میزبان کے خلیوں میں صرف چند اثر کرنے والے انجیکشن لگاتے ہیں جبکہ دوسرے درجنوں یا اس سے بھی سینکڑوں انجیکشن لگاتے ہیں۔ ایفیکٹر پروٹین میں بہت سی مختلف سرگرمیاں ہوسکتی ہیں، لیکن عام طور پر پیتھوجین کو میزبان بافتوں پر حملہ کرنے، اس کے مدافعتی نظام کو دبانے، یا بصورت دیگر روگزن کو زندہ رہنے میں مدد دیتے ہیں۔ ایفیکٹر پروٹین عام طور پر وائرس کے لیے اہم ہوتے ہیں۔ مثال کے طور پر، طاعون (Yersinia pestis) کے کارگر ایجنٹ میں، T3SS کا نقصان بیکٹیریا کو مکمل طور پر مہلک بنانے کے لیے کافی ہے، یہاں تک کہ جب وہ براہ راست خون کے دھارے میں داخل ہو جائیں۔ گرام منفی جرثوموں پر یہ بھی شبہ ہے کہ وہ بیکٹیریل بیرونی جھلی کے واسیکلز کو انفیکٹر پروٹین اور وائرلیس عوامل کو ایک جھلی ویسیکل اسمگلنگ سیکریٹری پاتھ وے کے ذریعے منتقل کرنے کے لیے تعینات کرتے ہیں، تاکہ اپنے ماحول میں ترمیم کریں یا ہدف کے خلیات پر حملہ/حملہ کریں، مثال کے طور پر، میزبان پیتھوجین انٹرفیس پر۔
بیکٹیریل ارتقاء/ بیکٹیریل ارتقاء:
بیکٹیریل ارتقاء بیکٹیریا کے حیاتیاتی ارتقاء کا حوالہ دے سکتا ہے جیسا کہ اس میں مطالعہ کیا گیا ہے: بیکٹیریا کی درجہ بندی بیکٹیریا کی نسل کی فہرست بیکٹیریل آرڈرز کی فہرست آرکیا جنیرا کی فہرست پروکاریوٹک ناموں کی فہرست ناموں میں کھڑے ہونے کے ساتھ بیکٹیریل فائیلوڈینامکس بیکٹیریل آرڈر b1989 بیکٹیریل فائیلا کا برانچنگ آرڈر (گپتا، 2001) بیکٹیریل فائیلا کا برانچنگ آرڈر (کیولیئر-اسمتھ، 2002) بیکٹیریل فائیلا کا برانچنگ آرڈر (ریپ اور جیوانونی، 2003) بیکٹیریل فائیلا کی برانچنگ آرڈر (Ciccarelli 2003) بیکٹیریل فائیلا (بیٹیسٹوزی ایٹ ال۔، 2004) 'دی آل اسپیسز لیونگ ٹری' پروجیکٹ برانچنگ آرڈر آف بیکٹیریل فائیلا (جینوم ٹیکسونومی ڈیٹا بیس، 2018)
Bacterial_filtration_efficiency/ بیکٹیریل فلٹریشن کی کارکردگی:
بیکٹیریل فلٹریشن ایفیشینسی یا BFE ایک سانس لینے والے مواد کی بیکٹیریا کے دخول کے خلاف مزاحمت کی پیمائش ہے۔ نتائج کو فیصد کارکردگی کے طور پر رپورٹ کیا جاتا ہے اور بیکٹیریا کے دخول کے خلاف مزاحمت کرنے کے تانے بانے کی صلاحیت سے تعلق رکھتے ہیں۔ اس ٹیسٹ میں زیادہ نمبر بہتر رکاوٹ کی کارکردگی کی نشاندہی کرتے ہیں۔ لپیٹ کے کپڑوں کا موازنہ گریڈ اور بنیادی وزن کی بنیاد پر کیا گیا۔
بیکٹیریل_فروٹ_بلاچ/ بیکٹیریل فروٹ دھبہ:
بیکٹیریل فروٹ بلوچ (BFB) دنیا بھر میں کیکربٹ کے پودوں کو متاثر کرتا ہے اور کسانوں کے لیے سنگین خطرہ ہو سکتا ہے کیونکہ یہ آلودہ بیج کے ذریعے پھیلتا ہے۔ BFB گرام منفی Acidovorax citrulli بیکٹیریا کے انفیکشن کا نتیجہ ہے، جس کا حال ہی میں تفصیل سے مطالعہ کیا گیا ہے۔ A. citrulli کے ارکان گرام منفی چھڑی کی شکل والے بیکٹیریا ہیں جن کے طول و عرض 0.5×1.7 μm ہیں۔ وہ قطبی فلاجیلا کے ذریعے حرکت کرتے ہیں۔ BFB مزاحمت کا کوئی معروف معتبر ذریعہ آج موجود نہیں ہے، لہذا بیج کی صفائی اور افزائش کی سہولیات کی مکمل جانچ پھیلاؤ کو کنٹرول کرنے کا بہترین طریقہ ہے۔ تاہم، BFB انفیکشن کو کم کرنے کے لیے کوئی معلوم کنٹرول طریقہ انتہائی قابل اعتماد نہیں ہے۔
بیکٹیریل_جینیٹکس/ بیکٹیریل جینیات:
بیکٹیریل جینیٹکس جینیات کا ذیلی فیلڈ ہے جو بیکٹیریا کے مطالعہ کے لیے وقف ہے۔ بیکٹیریل جینیات یوکریوٹک جینیات سے بالکل مختلف ہیں، تاہم بیکٹیریا اب بھی جانوروں کے جینیاتی مطالعہ کے لیے ایک اچھے نمونے کے طور پر کام کرتے ہیں۔ بیکٹیریا اور یوکرائیوٹک جینیات کے درمیان ایک بڑا فرق بیکٹیریا میں جھلی سے جڑے ہوئے آرگنیلز کی کمی سے پیدا ہوتا ہے (یہ تمام پروکیریوٹس کے بارے میں سچ ہے۔ جب کہ یہ ایک حقیقت ہے کہ پروکریوٹک آرگنیلز ہوتے ہیں، وہ کبھی بھی لپڈ جھلی کے پابند نہیں ہوتے، لیکن پروٹین کا ایک شیل)، ضروری پروٹین کی ترکیب سائٹوپلازم میں واقع ہوتی ہے۔ دوسرے جانداروں کی طرح، بیکٹیریا بھی سچی افزائش کرتے ہیں اور نسل در نسل اپنی خصوصیات کو برقرار رکھتے ہیں، پھر بھی ایک ہی وقت میں، اپنی نسل کے ایک چھوٹے سے تناسب میں خاص خصوصیات میں تغیرات کو ظاہر کرتے ہیں۔ اگرچہ بیکٹیریا کے ابتدائی دنوں سے ہی بیکٹیریا میں وراثت اور تغیرات کو دیکھا گیا تھا، لیکن اس وقت یہ محسوس نہیں ہوا کہ بیکٹیریا بھی جینیات کے قوانین کی پابندی کرتے ہیں۔ یہاں تک کہ بیکٹیریل نیوکلئس کا وجود بھی تنازعہ کا موضوع تھا۔ مورفولوجی اور دیگر خصوصیات میں فرق کو ناگیلی نے 1877 میں بیکٹیریل pleomorphism سے منسوب کیا، جس نے بیکٹیریا کی ایک ہی، چند انواع کے وجود کو ظاہر کیا، جس میں تغیر کے لیے پروٹین کی صلاحیت موجود تھی۔ خالص ثقافت کے درست طریقوں کی نشوونما اور اطلاق کے ساتھ، یہ واضح ہو گیا کہ بیکٹیریا کی مختلف اقسام پے در پے نسلوں تک مستقل شکل اور کام کو برقرار رکھتی ہیں۔ اس سے مونومورفزم کا تصور سامنے آیا۔
بیکٹیریل جینوم/ بیکٹیریل جینوم:
بیکٹیریل جینوم عام طور پر انواع کے درمیان سائز میں چھوٹے اور کم مختلف ہوتے ہیں جب یوکرائٹس کے جینوم کے مقابلے میں۔ بیکٹیریل جینوم کا سائز تقریباً 130 kbp سے لے کر 14 Mbp سے زیادہ ہو سکتا ہے۔ ایک مطالعہ جس میں 478 بیکٹیریل جینومز شامل تھے، لیکن ان تک محدود نہیں تھے، یہ نتیجہ اخذ کیا کہ جیسے جیسے جینوم کا سائز بڑھتا ہے، جینوں کی تعداد غیر یوکرائیوٹس کے مقابلے میں غیر متناسب طور پر سست رفتار سے بڑھتی ہے۔ اس طرح، نان کوڈنگ ڈی این اے کا تناسب بیکٹیریا کی نسبت غیر بیکٹیریا میں جینوم کے سائز کے ساتھ زیادہ تیزی سے بڑھ جاتا ہے۔ یہ اس حقیقت سے مطابقت رکھتا ہے کہ زیادہ تر یوکرائیوٹک جوہری ڈی این اے غیر جین کوڈنگ ہے، جب کہ پروکریوٹک، وائرل، اور آرگنیلر جینز کی اکثریت کوڈنگ کر رہی ہے۔ اس وقت، ہمارے پاس 50 مختلف بیکٹیریل فائیلا اور 11 مختلف آرکیئل فائیلا سے جینوم کی ترتیب ہے۔ دوسری نسل کی ترتیب نے بہت سے مسودہ جینوم حاصل کیے ہیں (جین بینک میں تقریباً 90% بیکٹیریل جینوم فی الحال مکمل نہیں ہیں)؛ تیسری نسل کی ترتیب بالآخر چند گھنٹوں میں مکمل جینوم حاصل کر سکتی ہے۔ جینوم کی ترتیب بیکٹیریا میں بہت زیادہ تنوع کو ظاہر کرتی ہے۔ 2000 سے زیادہ Escherichia coli جینوموں کے تجزیے سے تقریباً 3100 جین فیملیز اور کل تقریباً 89,000 مختلف جین فیملیز کا E. coli کور جینوم ظاہر ہوتا ہے۔ جینوم کی ترتیب سے پتہ چلتا ہے کہ پرجیوی بیکٹیریا میں 500-1200 جین ہوتے ہیں، آزاد زندہ بیکٹیریا میں 1500-7500 جین ہوتے ہیں، اور آرکیا میں 1500-2700 جین ہوتے ہیں۔ کول ایٹ ال کی ایک حیرت انگیز دریافت۔ لیپروسی بیسیلس کا آبائی بیکٹیریا سے موازنہ کرتے وقت بڑے پیمانے پر جین کے خاتمے کو بیان کیا گیا۔ اس کے بعد سے ہونے والے مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ کئی بیکٹیریا کے جینوم سائز ان کے آباؤ اجداد سے چھوٹے ہوتے ہیں۔ کئی سالوں میں، محققین نے بیکٹیریل جینوم کے زوال کے عمومی رجحان اور بیکٹیریل جینوم کے نسبتاً چھوٹے سائز کی وضاحت کے لیے کئی نظریات تجویز کیے ہیں۔ زبردست شواہد اس بات کی نشاندہی کرتے ہیں کہ بیکٹیریل جینوم کی ظاہری تنزلی حذف کرنے والے تعصب کی وجہ سے ہے۔
Bacterial_glutathione_transferase/Bacterial glutathione transferase:
بیکٹیریل گلوٹاتھیون ٹرانسفراسز (GSTs؛ EC 2.5.1.18) انزائمز کی ایک انتہائی فیملی کا حصہ ہیں جو سیلولر ڈیٹوکسیفیکیشن میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ GSTs کا بنیادی کردار مختلف قسم کے مالیکیولز کے الیکٹرو فیلک مراکز کے ساتھ گلوٹاتھیون (GSH) کے اتحاد کو متحرک کرنا ہے۔ جی ایس ٹی کے سب سے زیادہ معروف ذیلی ذخیرے زینو بائیوٹک مصنوعی کیمیکل ہیں۔ جی ایس ٹی کی ایسی کلاسیں بھی ہیں جو گلوٹاتھیون کو سبسٹریٹ کے بجائے کوفیکٹر کے طور پر استعمال کرتی ہیں۔ اکثر یہ جی ایس ٹی بیکٹیریم کے لیے زہریلے رد عمل آکسیڈیٹیو پرجاتیوں کو کم کرنے میں ملوث ہوتے ہیں۔ گلوٹاتھیون ریسیپٹرز کے ساتھ ملاپ زہریلے مادوں کو زیادہ گھلنشیل بناتا ہے، اور اس وجہ سے سیل سے زیادہ آسانی سے خارج ہو جاتا ہے۔
بیکٹیریل گروتھ/ بیکٹیریل گروتھ:
بیکٹیریا کی نشوونما دو بیٹیوں کے خلیوں میں بیکٹیریم کا پھیلاؤ ہے، ایک عمل میں جسے بائنری فیشن کہتے ہیں۔ بشرطیکہ کوئی واقعہ رونما نہ ہو، نتیجے میں پیدا ہونے والے بیٹی کے خلیے جینیاتی طور پر اصل خلیے سے ایک جیسے ہوتے ہیں۔ لہذا، بیکٹیریا کی ترقی ہوتی ہے. ڈویژن سے بیٹی کے دونوں خلیے ضروری نہیں کہ زندہ رہیں۔ تاہم، اگر زندہ بچ جانے والی تعداد اوسطاً اتحاد سے زیادہ ہے، تو بیکٹیریا کی آبادی تیزی سے بڑھ جاتی ہے۔ بیچ کلچر میں بیکٹیریل کی افزائش وکر کی پیمائش روایتی طور پر تمام مائکرو بایولوجسٹ کی تربیت کا حصہ تھی۔ بنیادی ذرائع کے لیے براہ راست اور انفرادی (مائکروسکوپک، فلو سائٹومیٹری)، براہ راست اور بلک (بائیو ماس)، بالواسطہ اور انفرادی (کالونی گنتی)، یا بالواسطہ اور بلک (سب سے زیادہ ممکنہ تعداد، ٹربائیٹی، غذائی اجزاء) کے ذریعے بیکٹیریل گنتی (سیل گنتی) کی ضرورت ہوتی ہے۔ طریقے ماڈل پیمائش کے ساتھ نظریہ کو ملاتے ہیں۔
بیکٹیریل_آئس-نیوکلیشن_پروٹینز/بیکٹیریل آئس نیوکلیشن پروٹین:
بیکٹیریل آئس نیوکلیشن پروٹین پروٹین کا ایک خاندان ہے جو گرام منفی بیکٹیریا کو نسبتاً زیادہ درجہ حرارت (-5C سے اوپر) پر برف کے نیوکلیشن کو فروغ دینے کے قابل بناتا ہے۔ یہ پروٹین بیرونی جھلی کی سطح پر مقامی ہوتے ہیں اور بہت سے پودوں کو ٹھنڈ سے نقصان پہنچا سکتے ہیں۔ پروٹین کی بنیادی ساخت میں ایک انتہائی بار بار ڈومین ہوتا ہے جو ترتیب پر غلبہ رکھتا ہے۔ ڈومین میں متعدد 48-ریسیڈیو ریپیٹس شامل ہیں، جو خود 16 اوشیشوں کے 3 بلاکس پر مشتمل ہیں، جن میں سے پہلے 8 ایک جیسے ہیں۔ یہ خیال کیا جاتا ہے کہ دہرایا جانے والا ڈومین بیج کرسٹل میں پانی کے مالیکیولز کو سیدھ میں لانے کے لیے ذمہ دار ہو سکتا ہے۔ [.........48.residues.repeated.domain..........] // | | \\ AGYGSTxTagxxssli AGYGSTxTagxxsxlt AGYGSTxTaqxxsxlt [16.residues...] [16.residues...] [16.residues...]
Bacterial_initiation_factor/بیکٹیریل شروع کرنے کا عنصر:
تمام بیکٹیریا کو تین ابتدائی عوامل کے استعمال کی ضرورت ہوتی ہے: IF1، اور IF2، ترجمہ کے لیے۔ کچھ فائیلا کو اضافی IF3 کی ضرورت ہوتی ہے۔
Bacterial_initiation_factor_1/ بیکٹیریل انیشیشن فیکٹر 1:
بیکٹیریل انیشیٹیشن فیکٹر 1 ایک بیکٹیریل انیشیشن فیکٹر ہے۔ IF1 A سائٹ میں 30S رائبوسومل سبونائٹ کے ساتھ منسلک ہوتا ہے اور ایک امینواسیل-tRNA کو داخل ہونے سے روکتا ہے۔ یہ IF2 کو رائبوزوم کے ساتھ اس کی وابستگی کو بڑھا کر پابند کرتا ہے۔ یہ 50S سبونائٹ کو بائنڈنگ سے بھی روک سکتا ہے، 70S سبونائٹ کی تشکیل کو روک سکتا ہے۔ اس میں نیوکلک ایسڈ بائنڈنگ پروٹین کے لیے ایک β-ڈومین فولڈ عام بھی ہوتا ہے۔ IF1–IF3 رائبوزوم ری سائیکلنگ بھی انجام دے سکتا ہے۔
Bacterial_initiation_factor_2/ بیکٹیریل انیشیشن فیکٹر 2:
بیکٹیریل انیشیشن فیکٹر-2 ایک بیکٹیریل انیشیشن فیکٹر ہے۔ IF2 ایک انیشیٹر tRNA سے منسلک ہوتا ہے اور رائبوزوم میں tRNA کے داخلے کو کنٹرول کرتا ہے۔ IF2، GTP کا پابند، 30S P سائٹ سے منسلک ہوتا ہے۔ 30S ذیلی یونٹ کے ساتھ منسلک ہونے کے بعد، fMet-tRNAf IF2 سے منسلک ہوتا ہے پھر IF2 tRNA کو جزوی P سائٹ میں منتقل کرتا ہے۔ جب 50S سبونائٹ جوائن کرتا ہے، تو یہ GTP کو GDP اور Pi سے ہائیڈولائز کرتا ہے، جس سے IF2 میں تبدیلی آتی ہے جس کی وجہ سے IF2 جاری ہوتا ہے اور 70S رائبوزوم بننے دیتا ہے۔ انسانی مائٹوکونڈریا ترجمہ شروع کرنے کے لیے جوہری انکوڈ شدہ ہومولوگ، MTIF2 کا استعمال کرتا ہے۔
بیکٹیریل_کڈنی_ڈیزیز/ بیکٹیریل گردے کی بیماری:
بیکٹیریل کڈنی ڈیزیز (BKD، جسے سفید پھوڑے کی بیماری بھی کہا جاتا ہے) ایک سیسٹیمیٹک انفیکشن ہے جو بیکٹیریم Renibacterium salmoninarum کی وجہ سے ہوتا ہے۔ یہ بیماری جنگلی سالمونیڈ کی آبادی کو متاثر کرتی ہے۔ BKD اصل میں 1933 میں سکاٹش دریاؤں Dee اور Spey میں دریافت ہوا تھا۔
بیکٹیریل لان / بیکٹیریل لان:
بیکٹیریل لان ایک اصطلاح ہے جو مائکرو بایولوجسٹ کے ذریعہ بیکٹیریل کالونیوں کی ظاہری شکل کو بیان کرنے کے لئے استعمال کیا جاتا ہے جب پیٹری ڈش ایگر پلیٹ پر تمام انفرادی کالونیاں بیکٹیریا کی کھیت یا چٹائی بنانے کے لئے مل جاتی ہیں۔ بیکٹیریل لان اینٹی بائیوٹک مزاحمت اور بیکٹیریوفیج ٹائٹرنگ کے لیے اسکرینوں میں استعمال ہوتے ہیں۔ بیکٹیریل لان (اکثر سیرٹیا مارسیسنس کے) بھی بڑے پیمانے پر استعمال ہوتے ہیں جب زمینی پانی کے بہاؤ کے مطالعے میں بیکٹیریوفیج کو ٹریسر کے طور پر استعمال کرتے وقت پرکھ کے طریقہ کار کے طور پر۔ اگرچہ کبھی کبھار بائیو فلم کے مترادف کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے، لیکن یہ اصطلاح بنیادی طور پر حیاتیات کے سادہ، کلونل، غیر ساختہ چٹائیوں پر لاگو ہوتی ہے جو عام طور پر صرف لیبارٹری گروتھ میڈیا پر بنتے ہیں۔ بائیو فلمز - مائکروجنزموں کی مجموعی شکل جو عام طور پر فطرت میں پائی جاتی ہے - عام طور پر زیادہ پیچیدہ اور متنوع ہوتے ہیں اور سیلولر بایوماس کے نسبت ایکسٹرا سیلولر ساختی میٹرکس کی بڑی مقدار سے نشان زد ہوتے ہیں۔
بیکٹیریل_لیف_سکارچ/ بیکٹیریل لیف اسکورچ:
بیکٹیریل لیف اسکورچ (عام طور پر مخفف BLS، جسے بیکٹیریل لیف اسپاٹ بھی کہا جاتا ہے) ایک بیماری کی حالت ہے جو بہت سی فصلوں کو متاثر کرتی ہے، جس کی وجہ بنیادی طور پر زائلم پلگنگ بیکٹیریا زائلیلا فاسٹیڈیوسا ہے۔ اسے ثقافتی طریقوں جیسے کہ ضرورت سے زیادہ فرٹیلائزیشن کی وجہ سے عام پتوں کے جھلس جانے کے لیے غلطی سے سمجھا جا سکتا ہے۔
بیکٹیریل_لیف_سٹریک/ بیکٹیریل لیف اسٹریک:
بیکٹیریل لیف اسٹریک (BLS) جسے بلیک چف بھی کہا جاتا ہے، گندم کی ایک عام بیکٹیریل بیماری ہے۔ یہ بیماری بیکٹیریل انواع Xanthomonas translucens pv کی وجہ سے ہوتی ہے۔ انڈولوسا روگزنق عالمی سطح پر پایا جاتا ہے، لیکن یہ امریکہ میں نچلے وسط جنوب میں ایک بنیادی مسئلہ ہے اور پیداوار کو 40 فیصد تک کم کر سکتا ہے۔[6] بی ایل ایس بنیادی طور پر بیج سے پیدا ہوتا ہے (بیماری بیج سے پھیلتی ہے) اور بیج کے اندر اور اس پر زندہ رہتی ہے، لیکن آف سیزن میں مٹی میں فصل کی باقیات میں بھی زندہ رہ سکتی ہے۔ بڑھتے ہوئے موسم کے دوران، بیکٹیریا پودے سے دوسرے پودے میں رابطے کے ذریعے منتقل ہو سکتے ہیں، لیکن یہ بنیادی طور پر بارش، ہوا اور کیڑوں کے رابطے سے پھیلتا ہے۔ بیکٹیریا نم ماحول میں پروان چڑھتا ہے، اور ایک کریم سے پیلے بیکٹیریا سے نکلتا ہے، جو خشک ہونے پر ہلکے رنگ کا اور پیمانہ جیسا دکھائی دیتا ہے، جس کے نتیجے میں پتوں پر ایک لکیر بنتی ہے۔ گندم کے سر پر حملہ آون پر necrotic بافتوں کے بینڈوں کا سبب بنتا ہے، جسے بلیک چاف کہتے ہیں۔[14] بیماری پر آسانی سے قابو نہیں پایا جاتا، کیونکہ انفیکشن کے علاج کے لیے بازار میں کوئی کیڑے مار دوا نہیں ہے۔ کچھ مزاحمتی کاشتیں دستیاب ہیں، لیکن بیج کا کوئی علاج موجود نہیں ہے۔ کچھ مربوط کیڑوں کے انتظام (IPM) تکنیکوں کو انفیکشن کو روکنے میں مدد کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے، حالانکہ کوئی بھی بیماری کو مکمل طور پر روک نہیں پائے گی۔[2]
بیکٹیریل_لیوسیل_امینو پیپٹائڈیس/بیکٹیریل لیوسیل امینو پیپٹائڈیس:
بیکٹیریل لیوسیل امینو پیپٹائڈیس (EC 3.4.11.10، Aeromonas proteolytica aminopeptidase) ایک انزائم ہے۔ یہ انزائم این ٹرمینل امینو ایسڈ، ترجیحی طور پر لیوسین، لیکن گلوٹامک یا ایسپارٹک ایسڈ کی نہیں یہ ایک زنک انزائم ہے۔
بیکٹیریل_مائکرو کمپارٹمنٹ/بیکٹیریل مائیکرو کمپارٹمنٹ:
بیکٹیریل مائیکرو کمپارٹمنٹس (BMCs) آرگنیل نما ڈھانچے ہیں، جو ایک پروٹین شیل پر مشتمل ہوتے ہیں جو انزائمز اور دیگر پروٹینوں کو گھیرے ہوئے ہوتے ہیں۔ BMCs عام طور پر تقریباً 40-200 نینو میٹر قطر کے ہوتے ہیں اور مکمل طور پر پروٹین سے بنتے ہیں۔ شیل ایک جھلی کی طرح کام کرتا ہے، کیونکہ یہ منتخب طور پر قابل رسائی ہے۔ بیکٹیریا اور آثار قدیمہ میں پائے جانے والے دیگر پروٹین پر مبنی کمپارٹمنٹس میں encapsulin nanocompartments اور gas vesicles شامل ہیں۔
بیکٹیریل مورفولوجیکل پلاسٹکٹی/ بیکٹیریل مورفولوجیکل پلاسٹکٹی:
بیکٹیریل مورفولوجیکل پلاسٹکٹی سے مراد شکل اور جسامت میں تبدیلیاں ہوتی ہیں جن سے بیکٹیریل خلیات دباؤ والے ماحول کا سامنا کرتے ہیں۔ اگرچہ بیکٹیریا نے اپنی شکل کو برقرار رکھنے کے لیے پیچیدہ مالیکیولر حکمت عملی تیار کی ہے، لیکن بہت سے پروٹسٹ شکاریوں، اینٹی بائیوٹکس، مدافعتی ردعمل، اور دیگر خطرات کے جواب میں بقا کی حکمت عملی کے طور پر اپنی شکل کو تبدیل کرنے کے قابل ہیں۔
بیکٹیریل موٹیلیٹی/ بیکٹیریل موٹیلٹی:
بیکٹیریل حرکت پذیری بیکٹیریا کی میٹابولک توانائی کا استعمال کرتے ہوئے آزادانہ طور پر حرکت کرنے کی صلاحیت ہے۔ زیادہ تر حرکتی میکانزم جو بیکٹیریا کے درمیان تیار ہوا وہ بھی آثار قدیمہ کے درمیان متوازی طور پر تیار ہوا۔ زیادہ تر چھڑی کے سائز کے بیکٹیریا اپنی طاقت کا استعمال کرتے ہوئے حرکت کرسکتے ہیں، جو نئے ماحول کی نوآبادیات اور بقا کے لیے نئے وسائل کی دریافت کی اجازت دیتا ہے۔ جراثیم کی نقل و حرکت کا انحصار نہ صرف میڈیم کی خصوصیات پر ہوتا ہے بلکہ آگے بڑھنے کے لیے مختلف ضمیموں کے استعمال پر بھی ہوتا ہے۔ بھیڑ اور تیراکی کی حرکات دونوں فلاجیلا گھومنے سے چلتی ہیں۔ جب کہ تیراکی سطح پر ایک کثیر خلوی 2D حرکت ہے اور اس میں سرفیکٹینٹس کی موجودگی کی ضرورت ہوتی ہے، تیراکی مائع ماحول میں انفرادی خلیوں کی حرکت ہے۔ ٹھوس سطحوں پر ہونے والی حرکت کی دیگر اقسام میں مروڑنا، گلائیڈنگ اور سلائیڈنگ شامل ہیں، جو تمام فلاجیلا سے آزاد ہیں۔ مروڑنا کا انحصار توسیع، سطح سے لگاؤ، اور قسم IV پیلی کے پیچھے ہٹنے پر ہوتا ہے جو خلیے کو آگے کی طرف کھینچتے ہیں جیسے کہ گریپلنگ ہک کے عمل کی طرح، سیل کو آگے بڑھنے کے لیے توانائی فراہم کرتا ہے۔ گلائیڈنگ مختلف موٹر کمپلیکسز کا استعمال کرتی ہے، جیسے کہ Myxococcus کے فوکل آسنجن کمپلیکس۔ مروڑ اور گلائیڈنگ موٹیلٹیز کے برعکس، جو کہ متحرک حرکتیں ہیں جہاں محرک قوت انفرادی خلیے کے ذریعے پیدا ہوتی ہے، سلائیڈنگ ایک غیر فعال حرکت ہے۔ یہ سرفیکٹینٹس کی موجودگی میں کالونی کے اندر خلیوں کی نشوونما کی وجہ سے پھیلنے والی قوتوں کی وجہ سے سیل کمیونٹی کے ذریعہ پیدا ہونے والی محرک قوت پر انحصار کرتا ہے، جو خلیوں اور سطح کے درمیان رگڑ کو کم کرتے ہیں۔ ایک بیکٹیریم کی مجموعی نقل و حرکت باری باری گڑبڑ اور تیراکی کے مراحل کا نتیجہ ہو سکتی ہے۔ نتیجتاً، یکساں ماحول میں تیراکی کرنے والے جراثیم کی رفتار نسبتاً سیدھی تیراکی کے ساتھ ایک بے ترتیب چہل قدمی کرے گی جو بیکٹیریم کو دوبارہ ترتیب دینے والے بے ترتیب گڑبڑوں سے رکاوٹ بنتی ہے۔ بیکٹیریا ٹیکسیوں کی بھی نمائش کر سکتے ہیں، جو اپنے ماحول میں محرکات کی طرف یا اس سے دور جانے کی صلاحیت ہے۔ کیموٹیکسس میں بیکٹیریا کی مجموعی حرکت کیمیائی میلان کی موجودگی کا جواب دیتی ہے۔ فوٹو ٹیکسس میں بیکٹیریا روشنی کی طرف یا دور جا سکتے ہیں۔ یہ خاص طور پر سائانو بیکٹیریا کے لیے مفید ہو سکتا ہے، جو روشنی سنتھیسز کے لیے استعمال کرتے ہیں۔ اسی طرح، میگنیٹوٹیکٹک بیکٹیریا اپنی حرکت کو زمین کے مقناطیسی میدان سے ہم آہنگ کرتے ہیں۔ کچھ بیکٹیریا کے رد عمل سے بچ جاتے ہیں جس کی وجہ سے وہ محرکات سے پیچھے ہٹ جاتے ہیں جو نقصان پہنچا سکتے ہیں یا مار سکتے ہیں۔ یہ نیویگیشن یا ایکسپلوریشن سے بنیادی طور پر مختلف ہے، کیونکہ جوابی اوقات تیز ہونا چاہیے۔ فرار کے رد عمل ایکشن پوٹینشل جیسے مظاہر کے ذریعے حاصل کیے جاتے ہیں، اور بائیو فلموں کے ساتھ ساتھ واحد خلیات جیسے کیبل بیکٹیریا میں بھی دیکھا گیا ہے۔ فی الحال بائیو ہائبرڈ مائیکرو سوئمرز، مائکروسکوپک تیراکوں کو تیار کرنے میں دلچسپی ہے جو حصہ حیاتیاتی ہیں اور جزوی طور پر انسانوں کے ذریعہ انجنیئر کیے گئے ہیں، جیسے تیراکی کے بیکٹیریا کارگو لے جانے کے لیے تبدیل کیے گئے ہیں۔
Bacterial_murein_precursor_exporter/ بیکٹیریل murein پیشگی برآمد کنندہ:
بیکٹیریل میورین پریسرسر ایکسپورٹر (ایم پی ای) فیملی (TC# 2.A.103) میمبرین ٹرانسپورٹرز کی سپر فیملی کیٹیشن ڈفیوژن سہولت کار (CDF) کا رکن ہے۔ ایم پی ای فیملی کے افراد گرام منفی اور گرام پازیٹو بیکٹیریا کی ایک بڑی قسم میں پائے جاتے ہیں اور لپڈ سے منسلک مورین (عرف پیپٹائڈوگلائکن) کے پیشرو کی نقل مکانی میں سہولت فراہم کرتے ہیں۔ MPE خاندان سے تعلق رکھنے والے پروٹینوں کی نمائندہ فہرست ٹرانسپورٹر کی درجہ بندی کے ڈیٹا بیس میں مل سکتی ہے۔
Bacterial_nanowires/بیکٹیریل نانوائرز:
بیکٹیریل نانوائرز (جسے مائکروبیل نانوائرز بھی کہا جاتا ہے) برقی طور پر چلنے والے ضمیمہ ہیں جو بہت سے بیکٹیریا کے ذریعہ تیار کیے جاتے ہیں خاص طور پر جیو بیکٹر اور شیوانیلا جنیرا سے (لیکن خصوصی نہیں)۔ آکسیجنک سیانوبیکٹیریم Synechocystis PCC6803 اور Pelotomaculum thermopropionicum اور Methanothermobacter thermoautotrophicus پر مشتمل ایک تھرموفیلک، میتھانوجینک کوکلچر میں بھی کنڈکٹو نینوائرز کی تصدیق ہوئی ہے۔ جسمانی اور فعال نقطہ نظر سے، بیکٹیریل نانوائرز متنوع ہیں۔ مائکروبیل نانوائرز اپنے حیاتیاتی نظام میں جو قطعی کردار ادا کرتے ہیں اسے مکمل طور پر محسوس نہیں کیا گیا ہے، لیکن کئی مجوزہ افعال موجود ہیں۔ قدرتی طور پر پائے جانے والے ماحول سے باہر، بیکٹیریل نانوائرز نے کئی شعبوں میں کارآمد ہونے کی صلاحیت ظاہر کی ہے، خاص طور پر بائیو انرجی اور بائیو میڈیشن انڈسٹریز۔
Bacterial_neuraminidase/Bacterial neuraminidase:
بیکٹیریل نیورامینیڈیس نیورامینیڈیز کی قسم ہے اور بہت سے بیکٹیریا کے لیے وائرلیس عنصر ہے جس میں بیکٹیرائڈز فریگیلیس اور سیوڈموناس ایروگینوسا شامل ہیں۔ اس کا کام ganglioside-GM1 (خلیہ کی سطح اور رسیپٹر کی سرگرمی کا ایک ماڈیولیٹر) سے سیالک ایسڈ کی باقیات کو ختم کرنا ہے اور اسے asialo-GM1 میں تبدیل کرنا ہے جس سے ٹائپ 4 پیلی (منسلک عوامل) ترجیحی طور پر منسلک ہوتے ہیں۔
بیکٹیریل ون ہائبرڈ سسٹم/ بیکٹیریل ون ہائبرڈ سسٹم:
بیکٹیریل ون ہائبرڈ (B1H) سسٹم ڈی این اے بائنڈنگ ڈومین کی ترتیب سے مخصوص ہدف کی جگہ کی شناخت کا ایک طریقہ ہے۔ اس نظام میں، دیئے گئے ٹرانسکرپشن فیکٹر (TF) کو RNA پولیمریز کے ذیلی یونٹ میں فیوژن کے طور پر ظاہر کیا جاتا ہے۔ متوازی طور پر، ممکنہ TF ہدف کے سلسلے کی نمائندگی کرنے والے بے ترتیب اولیگونوکلیوٹائڈس کی ایک لائبریری کو ایک علیحدہ ویکٹر میں کلون کیا جاتا ہے جس میں منتخب جین HIS3 اور URA3 ہوتے ہیں۔ اگر ڈی این اے بائنڈنگ ڈومین (بیت) Vivo میں ممکنہ DNA ٹارگٹ سائٹ (شکار) کو باندھتا ہے، تو یہ RNA پولیمریز کو پروموٹر میں بھرتی کرے گا اور اس کلون میں رپورٹر جینز کی نقل کو چالو کرے گا۔ دو رپورٹر جین، HIS3 اور URA3، بالترتیب مثبت اور منفی انتخاب کی اجازت دیتے ہیں۔ عمل کے اختتام پر، مثبت کلون ترتیب دیے جاتے ہیں اور ڈی این اے کے مطلوبہ ہدف کی ترتیب کو حل کرنے کے لیے موٹیف فائنڈنگ ٹولز کے ساتھ ان کی جانچ کی جاتی ہے۔
بیکٹیریل_آؤٹر_میمبرین/بیکٹیریل بیرونی جھلی:
بیکٹیریا کی بیرونی جھلی گرام منفی بیکٹیریا میں پائی جاتی ہے۔ اس کی ساخت اندرونی سائٹوپلاسمک سیل جھلی سے الگ ہے - دوسری چیزوں کے علاوہ، بہت سے گرام منفی بیکٹیریا کی بیرونی جھلی کے بیرونی لیفلیٹ میں ایک پیچیدہ لیپوپولیساکرائڈ شامل ہے جس کا لپڈ حصہ اینڈوٹوکسین کے طور پر کام کرتا ہے - اور کچھ بیکٹیریا جیسے ای۔ coli یہ براؤن کے لیپوپروٹین کے ذریعہ سیل کے پیپٹائڈوگلیان سے منسلک ہے۔ پورن اس تہہ میں پایا جا سکتا ہے۔
Bacterial_outer_membrane_vesicles/ بیکٹیریل بیرونی جھلی کے vesicles:
بیکٹیریل آؤٹر میمبرین ویسیکلز (OMVs) گرام نیگیٹیو بیکٹیریا کی بیرونی جھلیوں سے خارج ہونے والے لپڈس کے واسیکلز ہیں۔ یہ vesicles دریافت کیے جانے والے پہلے بیکٹیریل میمبرین vesicles (MVs) تھے، جبکہ گرام پازیٹو بیکٹیریا بھی vesicles جاری کرتے ہیں۔ بیرونی جھلیوں کے واسیکلز کو پہلی بار 1966-67 میں ہندوستانی سائنسدان پروفیسر اسمرتی نارائن چٹرجی اور جے داس نے ٹرانسمیشن الیکٹران مائکروسکوپی کے ذریعے دریافت کیا تھا۔ OMVs کو ان کے ماحول میں دوسرے مائکروجنزموں کے ساتھ اور میزبان کے ساتھ آپس میں بات چیت کرنے کا طریقہ فراہم کرنے کی فعالیت سے منسوب کیا جاتا ہے۔ یہ ویسیکلز بیکٹیریل سیل سگنلنگ بائیو کیمیکلز کی اسمگلنگ میں ملوث ہیں، جن میں ڈی این اے، آر این اے، پروٹین، اینڈوٹوکسین اور الائیڈ وائرلینس مالیکیول شامل ہو سکتے ہیں۔ یہ مواصلت سمندروں، جانوروں، پودوں اور یہاں تک کہ انسانی جسم کے اندر مائکروبیل ثقافتوں میں ہوتی ہے۔ گرام منفی بیکٹیریا اپنے ماحول میں خلیات کو نشانہ بنانے کے لیے بیکٹیریل بائیو کیمیکلز کی اسمگلنگ کے لیے OMVs کے اخراج کے لیے اپنے پیری پلاسم کو تعینات کرتے ہیں۔ OMVs ان کے میزبان میں بیماری کے عمل کو شروع کرنے والے اینڈوٹوکسک لیپوپولیساکرائڈ بھی لے جاتے ہیں۔ یہ میکانزم مختلف قسم کے فوائد فراہم کرتا ہے جیسے، کم سے کم ہائیڈرولائٹک انحطاط اور اضافی سیلولر ڈیلیوشن کے ساتھ بیکٹیریل سیکریٹری کارگو کی طویل فاصلے تک ترسیل، کسی خاص کام کو پورا کرنے کے لیے دوسرے معاون مالیکیولز (مثلاً وائرلینس عوامل) کے ساتھ بھی شامل کیا جاتا ہے اور پھر بھی، محفوظ رکھنا۔ - ھدف بنائے گئے خلیات کے دفاعی ہتھیاروں سے فاصلہ۔ OMVs کے ذریعے اسمگل کیے جانے والے بائیو کیمیکل سگنلز 'جنگ اور امن' کے حالات میں بڑے پیمانے پر مختلف ہو سکتے ہیں۔ 'مطمئن' بیکٹیریل کالونیوں میں، OMVs کو جینیاتی تبدیلیوں کے لیے 'متعلقہ' جرثوموں تک DNA لے جانے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے، اور کورم سینسنگ اور بائیو فلم کی تشکیل کے لیے سیل سگنلنگ مالیکیولز کو بھی منتقل کیا جا سکتا ہے۔ آس پاس کی دیگر سیل اقسام سے 'چیلنج' کے دوران، OMVs کو انحطاط اور تخریبی خامروں کو لے جانے کے لیے ترجیح دی جا سکتی ہے۔ اسی طرح، OMVs میں میزبان پیتھوجین انٹرفیس (تصویر 1) میں زیادہ حملہ آور پروٹین شامل ہو سکتے ہیں۔ یہ توقع کی جاتی ہے، کہ خفیہ جرثوموں کے ارد گرد ماحولیاتی عوامل ان بیکٹیریا کو خاص طور پر افزودہ OMVs کی ترکیب اور اخراج کے لیے اکسانے کے لیے ذمہ دار ہیں، جو جسمانی طور پر فوری کام کے لیے موزوں ہیں۔ اس طرح، بیکٹیریل OMVs، مضبوط امیونو موڈولیٹر ہونے کی وجہ سے، ان کے امیونوجینک مواد کے لیے ہیرا پھیری کی جا سکتی ہے اور انسانوں اور جانوروں کو خطرناک انفیکشن کے خلاف حفاظتی ٹیکوں کے لیے طاقتور پیتھوجین فری ویکسین کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے۔
بیکٹیریل_آکسیڈیشن/بیکٹیریل آکسیکرن:
بیکٹیریا بائیو آکسیڈیشن ایک آکسیکرن عمل ہے جو جرثوموں کی وجہ سے ہوتا ہے جہاں ٹھوس مرحلے میں قیمتی دھات باقی رہتی ہے (لیکن افزودہ ہوجاتی ہے)۔ اس عمل میں، دھات ٹھوس مرحلے میں رہتی ہے اور مائع کو ضائع کیا جا سکتا ہے۔ بیکٹیریل آکسیڈیشن ایک بائیو ہائیڈرومیٹالرجیکل عمل ہے جو ریفریکٹری سونے کی دھاتوں یا کنسنٹریٹس کے پری سائینڈیشن علاج کے لیے تیار کیا گیا ہے۔ بیکٹیریل کلچر Acidithiobacillus ferrooxidans، Acidithiobacillus thiooxidans اور Leptospirillum ferrooxidans کی مخلوط ثقافت ہے۔ بیکٹیریل آکسیڈیشن کے عمل میں ریفریکٹری سلفائیڈ ROM ایسک سے رابطہ کرنا یا بیکٹیریل کلچر کے تناؤ کے ساتھ توجہ مرکوز کرنا ایک بہترین آپریٹنگ ماحول کے تحت مناسب علاج کی مدت پر مشتمل ہے۔ بیکٹیریا سلفائیڈ معدنیات کو آکسائڈائز کرتے ہیں، اس طرح سائینڈیشن کے ذریعے بعد میں بحالی کے لیے بند سونے کو آزاد کر دیتے ہیں۔ BIOX® عمل ایک ملکیتی ٹیکنالوجی ہے جو Biomin جنوبی افریقہ کی ملکیت ہے اور لائسنس کے تحت متعدد آپریٹنگ مائنز استعمال کرتی ہے۔ BIOX® کے عمل میں ریفریکٹری ایسک کے پہلے سے علاج کے لیے مشتعل ٹینکوں میں بیکٹیریل آکسیڈیشن شامل ہے اور سونے کی بازیافت کے لیے روایتی سائینائیڈ لیچ سے پہلے توجہ مرکوز کرتا ہے۔ پلانٹ کے کنٹرول شدہ حالات میں، بیکٹیریل خلیوں کی تعداد اور ان کی سرگرمی کو سلفائیڈ آکسیڈیشن کی بلند ترین شرح حاصل کرنے کے لیے بہتر بنایا جاتا ہے۔ بیکٹیریا کو بہت تیزابی ماحول (pH 1.0 سے 4.0)، 30 اور 45 ° C کے درمیان درجہ حرارت، اور زیادہ سے زیادہ نشوونما اور سرگرمی کے لیے آکسیجن اور کاربن ڈائی آکسائیڈ کی مسلسل فراہمی کی ضرورت ہوتی ہے۔ بیکٹیریا کے لیے غیر معمولی آپریٹنگ حالات زیادہ تر دوسرے جرثوموں کی نشوونما کے لیے سازگار نہیں ہیں، اس طرح بیکٹیریا کے آکسیکرن کے عمل کے دوران بانجھ پن کی ضرورت ختم ہو جاتی ہے۔ چونکہ نامیاتی مادے بیکٹیریا کے لیے زہریلے ہوتے ہیں، وہ غیر پیتھوجینک اور بیماری پیدا کرنے کے قابل نہیں ہوتے۔ اس عمل میں استعمال ہونے والے بیکٹیریا انسانوں یا کسی جانور کے لیے صحت کے لیے خطرہ نہیں بنتے۔ آئرن سلفائیڈ معدنیات کے بیکٹیریل آکسیڈیشن سے آئرن (III) سلفیٹ اور سلفیورک ایسڈ پیدا ہوتا ہے، اور آرسنوپیرائٹ کی صورت میں، آرسینک ایسڈ بھی تیار ہوتا ہے۔ آرسینک کو دو مراحل کے غیر جانبداری کے عمل میں آئرن اور سلفیٹ کے ساتھ مل کر شراب سے ہٹا دیا جاتا ہے۔ یہ ایک ٹھوس نیوٹرلائزیشن پریپیٹیٹ پیدا کرتا ہے جس میں بڑے پیمانے پر کیلشیم سلفیٹ، بنیادی آئرن (III) آرسینیٹ اور آئرن (III) ہائیڈرو آکسائیڈ ہوتا ہے۔ آئرن (III) آرسنیٹ کافی حد تک غیر حل پذیر اور مستحکم ہے تاکہ نیوٹرلائزیشن پروڈکٹ کو سلائمز ڈیم پر محفوظ طریقے سے ٹھکانے لگایا جاسکے۔ نیوٹرلائزیشن شراب، جو سنکھیا کی قابل قبول سطح پر مشتمل ہونے کے لیے پاک کی جاتی ہے، ملنگ، فلوٹیشن یا بیکٹیریل آکسیڈیشن سرکٹس میں دوبارہ استعمال کی جا سکتی ہے۔
بیکٹیریل پیٹرنز/ بیکٹیریل پیٹرن:
بیکٹیریل کالونیوں کی نشوونما میں نمونوں کی تشکیل کا تجرباتی طور پر بڑے پیمانے پر مطالعہ کیا گیا ہے۔ نتیجہ خیز شکلیں نمو کے حالات پر منحصر نظر آتی ہیں۔ ان میں معروف شکلیں شامل ہیں جیسے کہ گھنے برانچڈ مورفولوجی (DBM) یا ڈفیوژن لمیٹڈ ایگریگیشن (DLA)، لیکن بہت زیادہ پیچیدہ نمونے اور وقتی سلوک پایا جا سکتا ہے۔ بیکٹیریل کالونیوں میں پیٹرن کی تشکیل کے بارے میں بڑی تعداد میں مطالعہ Bacillus subtilis اور Proteus mirabilis میں کیے گئے ہیں۔ کالونی کی ترقی کی ریاضیاتی ماڈلنگ مشاہدہ شدہ شکلوں اور ماحولیاتی تبدیلیوں کے اثر کو دوبارہ پیش کر سکتی ہے۔ ملازم ماڈلز میں شامل ہیں: رد عمل – بازی سسٹم سیلولر آٹو میٹا
بیکٹیریل فائیلا/ بیکٹیریل فائیلا:
بیکٹیریل فائیلا ڈومین بیکٹیریا کے بڑے نسبوں پر مشتمل ہے۔ جب کہ بیکٹیریل فیلم کی صحیح تعریف پر بحث ہوتی ہے، ایک مشہور تعریف یہ ہے کہ بیکٹیریل فائلم بیکٹیریا کا ایک مونو فیلیٹک نسب ہے جس کے 16S rRNA جین دوسرے بیکٹیریل فائیلا کے ارکان کے ساتھ ~75% یا اس سے کم جوڑے کی ترتیب کی شناخت کا اشتراک کرتے ہیں۔ یہ اندازہ لگایا گیا ہے کہ ~ 1,300 بیکٹیریل فائیلا موجود ہیں۔ مئی 2020 تک، LPSN کی طرف سے 41 بیکٹیریل فائیلا کو باضابطہ طور پر قبول کیا گیا ہے، سلوا ڈیٹا بیس پر 89 بیکٹیریل فائیلا کو تسلیم کیا گیا ہے، درجنوں مزید تجویز کیے گئے ہیں، اور سینکڑوں کی دریافت ہونے کا امکان ہے۔ 2017 تک، تقریباً 72% وسیع پیمانے پر تسلیم شدہ بیکٹیریل فائیلا امیدوار فائیلا تھے (یعنی کوئی مہذب نمائندے نہیں ہیں)۔ بیکٹیریل فائیلا کے نام کے لیے کوئی مقررہ اصول نہیں ہیں۔ یہ تجویز کیا گیا تھا کہ لاحقہ "بیکٹیریا" فائیلا کے لیے استعمال کیا جائے۔
بیکٹیریل فائیلوڈینامکس/ بیکٹیریل فائیلوڈینامکس:
بیکٹیریل فائیلوڈینامکس ان پیتھوجینز کے ارتقائی کردار کو بہتر طور پر سمجھنے کے لیے امیونولوجی، ایپیڈیمولوجی، اور بیکٹیریل پیتھوجینز کے فائیلوجنیٹکس کا مطالعہ ہے۔ Phylodynamic تجزیہ میں جینیاتی تنوع، قدرتی انتخاب، اور وبائی امراض کے دوران متعدی بیماری کے پیتھوجین فائیلوجنیز کی آبادی کی حرکیات کا تجزیہ کرنا اور وائرس کے انٹرا میزبان ارتقاء کا مطالعہ شامل ہے۔ Phylodynamics ان میکانزم کو بہتر طور پر سمجھنے کے لیے فائیلوجنیٹک تجزیہ، ماحولیاتی، اور ارتقائی عمل کے مطالعہ کو یکجا کرتا ہے جو بیکٹیریل پیتھوجینز کے spatiotemportal واقعات اور فائیلوجنیٹک نمونوں کو چلاتے ہیں۔ بیکٹیریل فائیلوڈینامکس بیکٹیریل پیتھوجینز کے ارتقائی طریقہ کار کو بہتر طور پر سمجھنے کے لیے جینوم وائیڈ سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم (SNP) کا استعمال کرتا ہے۔ وائرس پر بہت سے فائیلوڈینامک مطالعہ کیے گئے ہیں، خاص طور پر آر این اے وائرس (دیکھیں وائرل فائیلوڈینامکس) جن میں تغیر کی شرح زیادہ ہے۔ اگلی نسل کی ترتیب کی ترقی اور دستیاب ڈیٹا کی مقدار کی وجہ سے بیکٹیریل فائیلوڈینامکس کے شعبے میں کافی اضافہ ہوا ہے۔
بیکٹیریل نمونیا/بیکٹیریل نمونیا:
بیکٹیریل نمونیا ایک قسم کا نمونیا ہے جو بیکٹیریل انفیکشن کی وجہ سے ہوتا ہے۔
بیکٹیریل_پوٹاشیم_ٹرانسپورٹر/ بیکٹیریل پوٹاشیم ٹرانسپورٹر:
یہ پروٹین فیملی مختلف پوٹاشیم ٹرانسپورٹ پروٹین (Trk) اور وی قسم کے سوڈیم اے ٹی پی سنتھیس سبونائٹ جے یا ٹرانسلوکیٹنگ اے ٹی پیز جے (ای سی) پر مشتمل ہے۔ یہ پروٹین عمل میں ATP کا استعمال کرتے ہوئے فعال سوڈیم لینے میں شامل ہیں۔ Escherichia coli سے TrkH ایک ٹرانس میمبرن پروٹین ہے اور اس جاندار میں TrK سسٹم کے ذریعہ کیٹیشن ٹرانسپورٹ کی خصوصیات اور حرکیات کا تعین کرتا ہے۔ یہ پروٹین TrkA کے ساتھ تعامل کرتا ہے اور نقل و حمل کی سرگرمی کے لئے TrkE کی ضرورت ہوتی ہے۔
بیکٹیریل_ریکمبینیشن/ بیکٹیریل دوبارہ ملاپ:
بیکٹیریل ری کنبینیشن بیکٹیریا میں جینیاتی بحالی کی ایک قسم ہے جس کی خصوصیت ایک جاندار سے ڈی این اے کی منتقلی سے ہوتی ہے جسے ڈونر کہتے ہیں دوسرے جاندار کو بطور وصول کنندہ۔ یہ عمل تین اہم طریقوں سے ہوتا ہے: تبدیلی، ارد گرد کے ماحول سے خارجی ڈی این اے کا اخراج۔ نقل و حمل، بیکٹیریا کے درمیان ڈی این اے کی وائرس ثالثی منتقلی۔ کنجوجیشن، ڈی این اے کی ایک بیکٹیریم سے دوسرے میں سیل ٹو سیل رابطے کے ذریعے منتقلی۔ کنجوجیشن، ٹرانزیکشن، اور/یا تبدیلی کا حتمی نتیجہ جینیاتی دوبارہ پیدا ہونے والے مادوں کی پیداوار ہے، ایسے افراد جو نہ صرف اپنے والدین سے وراثت میں ملنے والے جین لے کر جاتے ہیں۔ خلیات بلکہ ان کے جینوم کو جوڑ، نقل و حمل، اور/یا تبدیلی کے ذریعے متعارف کرایا جاتا ہے۔ یہ recombinases ڈی این اے کے نقصانات کو ہومولوگس ری کمبینیشن کے ذریعے مرمت کو فروغ دیتے ہیں۔ قدرتی تبدیلی سے گزرنے کی صلاحیت کم از کم 67 بیکٹیریل انواع میں موجود ہے۔ پیتھوجینک بیکٹیریل پرجاتیوں میں قدرتی تبدیلی عام ہے۔ بعض صورتوں میں، تبدیلی کے دوران دوبارہ ملاپ کے ذریعے فراہم کردہ ڈی این اے کی مرمت کی صلاحیت متاثرہ بیکٹیریل پیتھوجین کی بقا میں سہولت فراہم کرتی ہے۔ بیکٹیریل تبدیلی متعدد بات چیت کرنے والے بیکٹیریل جین مصنوعات کے ذریعہ کی جاتی ہے۔
بیکٹیریل_روڈوپسن/بیکٹیریل روڈوپسن:
بیکٹیریل روڈوپسن کا حوالہ دے سکتے ہیں: مائکروبیل روڈوپسن، جسے ٹائپ-1 روڈوپسن بھی کہا جاتا ہے، بیکٹیریورہوڈپسن، مائکروبیل روڈوپسن کی ایک قسم
بیکٹیریل_سیکریشن_سسٹم/بیکٹیریل سراو کا نظام:
بیکٹیریل سراو کے نظام پروٹین کمپلیکس ہیں جو مادوں کی رطوبت کے لیے بیکٹیریا کی سیل جھلیوں پر موجود ہوتے ہیں۔ خاص طور پر، وہ سیلولر ڈیوائسز ہیں جو پیتھوجینک بیکٹیریا اپنے وائرلیس عوامل (بنیادی طور پر پروٹینز) کو میزبان خلیوں پر حملہ کرنے کے لیے استعمال کرتے ہیں۔ انہیں ان کی مخصوص ساخت، ساخت اور سرگرمی کی بنیاد پر مختلف اقسام میں تقسیم کیا جا سکتا ہے۔ عام طور پر، پروٹین کو دو مختلف عملوں کے ذریعے خفیہ کیا جا سکتا ہے۔ ایک عمل ایک قدمی طریقہ کار ہے جس میں بیکٹیریا کے سائٹوپلازم سے پروٹین کو سیل کی جھلی کے ذریعے براہ راست میزبان سیل میں پہنچایا جاتا ہے۔ ایک اور میں دو قدمی سرگرمی شامل ہوتی ہے جس میں پروٹین کو پہلے اندرونی خلیے کی جھلی سے باہر منتقل کیا جاتا ہے، پھر پیری پلاسم میں جمع کیا جاتا ہے، اور آخر میں بیرونی خلیے کی جھلی کے ذریعے میزبان خلیے میں۔ ڈیڈرم) اور گرام پازیٹو بیکٹیریا (مونوڈرم)۔ لیکن درجہ بندی کسی بھی طرح سے واضح اور مکمل نہیں ہے۔ گرام منفی بیکٹیریا کے لیے کم از کم آٹھ قسمیں مخصوص ہیں، چار گرام پازیٹو بیکٹیریا کے لیے، جبکہ دو دونوں میں مشترک ہیں۔ اس کے علاوہ، بیرونی جھلی پر لیپوپولیساکرائیڈ والے ڈیڈرم بیکٹیریا (ڈیڈرم-ایل پی ایس) اور مائکولک ایسڈ (ڈیڈرم-مائکولیٹ) کے درمیان قابل تعریف فرق ہے۔
بیکٹیریل سنسنینس/ بیکٹیریل سنسنی
بیکٹیریل سنسنی یا بیکٹیریا کی عمر بڑھنے سے مراد انفرادی بیکٹیریا میں سیلولر فنکشن میں بتدریج کمی ہے کیونکہ وہ عمر میں اضافہ کرتے ہیں۔ سنسنی کے اشارے میں تقسیم کی شرح میں کمی اور موت کے امکانات میں اضافہ شامل ہے۔ بیکٹیریا میں عمر بڑھنے کی بنیادی وجہ نقصان دہ اجزاء (عمر بڑھنے کے عوامل) کا جمع ہونا سمجھا جاتا ہے۔ غیر متناسب طور پر تقسیم کرنے والے بیکٹیریا، جیسے کاولوبیکٹر کریسنٹس، نقلی عمر بڑھنے کی علامات ظاہر کرتے ہیں۔ بیکٹیریا کو ہم آہنگی سے تقسیم کرنے کے نتائج زیادہ اہم ہیں۔ مثال کے طور پر، Escherichia coli، بعض تجرباتی حالات کے تحت، اس کی تقسیم میں ٹھیک ٹھیک عدم توازن کی وجہ سے نقلی عمر بڑھنے کی علامات ظاہر کر سکتا ہے۔
Bacterial_small_RNA/بیکٹریل چھوٹا RNA:
بیکٹیریل چھوٹے RNAs (sRNA) بیکٹیریا کے ذریعہ تیار کردہ چھوٹے RNAs ہیں۔ وہ 50- سے 500-نیوکلیوٹائڈ نان کوڈنگ آر این اے مالیکیولز ہیں، انتہائی ساختی اور کئی اسٹیم لوپس پر مشتمل ہیں۔ متعدد sRNAs کی شناخت کمپیوٹیشنل تجزیہ اور لیبارٹری پر مبنی تکنیکوں جیسے شمالی بلوٹنگ، مائیکرو رے اور RNA-Seq جیسے بیکٹیریل انواع کی ایک بڑی تعداد میں کی گئی ہے جس میں ایسچریچیا کولی، ماڈل پیتھوجین سالمونیلا، نائٹروجن فکسنگ الفاپروٹیوبیکٹیریم، ماریلوبیٹیریا، مریلوبیٹیریا، ماریلوبیٹیریا شامل ہیں۔ Francisella tularensis (tulariaemia کا سبب بننے والا ایجنٹ)، Streptococcus pyogenes، pathogen Staphylococcus aureus، اور پودوں کا پیتھوجین Xanthomonas oryzae pathovar oryzae۔ بیکٹیریل ایس آر این اے اس بات پر اثر انداز ہوتے ہیں کہ ایم آر این اے یا پروٹین کے ساتھ تعامل کے ذریعے بیکٹیریل خلیوں کے اندر جین کا اظہار کس طرح ہوتا ہے، اور اس طرح یہ مختلف قسم کے بیکٹیریل افعال جیسے میٹابولزم، وائرلیس، ماحولیاتی تناؤ کے ردعمل، اور ساخت کو متاثر کر سکتا ہے۔
بیکٹیریل_سافٹ_روٹ/ بیکٹیریل نرم روٹ:
بیکٹیریل نرم روٹس کئی قسم کے بیکٹیریا کی وجہ سے ہوتے ہیں، لیکن زیادہ تر گرام منفی بیکٹیریا، ایرونیا، پیکٹوبیکٹیریم اور سیوڈموناس کی انواع کی وجہ سے ہوتے ہیں۔ یہ پھلوں، سبزیوں اور زیورات کی ایک تباہ کن بیماری ہے جو دنیا بھر میں پائی جاتی ہے، اور تقریباً تمام پودوں کے خاندانوں کی نسل کو متاثر کرتی ہے۔ بیکٹیریا بنیادی طور پر اپنے میزبانوں کے گوشت کے ذخیرہ کرنے والے اعضاء (tubers، corms، بلب اور rhizomes) پر حملہ کرتے ہیں، لیکن وہ رسیلی کلیوں، تنوں اور پیٹیول ٹشوز کو بھی متاثر کرتے ہیں۔ خصوصی انزائمز کی مدد سے، پودے کو ایک مائع مشک میں تبدیل کر دیا جاتا ہے تاکہ بیکٹیریا پودوں کے خلیے کے غذائی اجزاء کو استعمال کر سکیں۔ سٹوریج یا ٹرانزٹ کے دوران متاثرہ اور صحت مند بافتوں کے درمیان سادہ جسمانی تعامل کی وجہ سے بیماری پھیل سکتی ہے۔ یہ بیماری کیڑوں سے بھی پھیل سکتی ہے۔ بیماری کا کنٹرول ہمیشہ زیادہ مؤثر نہیں ہوتا ہے، لیکن پیداوار، ذخیرہ کرنے اور پروسیسنگ میں حفظان صحت کے طریقے کچھ ایسے ہیں جو بیماری کے پھیلاؤ کو کم کرنے اور پیداوار کی حفاظت کے لیے کیے جا سکتے ہیں۔
بیکٹیریل_سٹریس_رسپانس/بیکٹیریل تناؤ کا ردعمل:
بیکٹیریل تناؤ کا ردعمل بیکٹیریا کو اپنے قریبی ماحول میں منفی اور اتار چڑھاؤ والے حالات میں زندہ رہنے کے قابل بناتا ہے۔ مختلف بیکٹیریل میکانزم مختلف ماحولیاتی تبدیلیوں کو تسلیم کرتے ہیں اور مناسب ردعمل کو ماؤنٹ کرتے ہیں۔ ایک بیکٹیریل سیل مختلف قسم کے تناؤ پر بیک وقت رد عمل ظاہر کر سکتا ہے اور مختلف تناؤ کے ردعمل کے نظام عالمی ریگولیٹری نیٹ ورکس کے ایک کمپلیکس کے ذریعے ایک دوسرے کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ تبدیلیوں کو محسوس کریں اور جین کے اظہار اور پروٹین کی سرگرمی میں مناسب ردعمل کو ماؤنٹ کریں۔ بیکٹیریا میں تناؤ کے ردعمل میں عناصر کا ایک پیچیدہ نیٹ ورک شامل ہوتا ہے جو بیرونی محرک کا مقابلہ کرتا ہے۔ بیکٹیریا متعدد تناؤ پر بیک وقت رد عمل ظاہر کر سکتے ہیں اور تناؤ کے ردعمل کے مختلف نظام ایک دوسرے کے ساتھ تعامل (کراس ٹاک) کرتے ہیں۔ عالمی ریگولیٹری نظاموں کا ایک پیچیدہ نیٹ ورک ایک مربوط اور موثر ردعمل کا باعث بنتا ہے۔ یہ ریگولیٹری نظام زیادہ اثر کرنے والوں کے اظہار پر حکومت کرتے ہیں جو مختلف حالات میں سیلولر توازن کے استحکام کو برقرار رکھتے ہیں۔ ان نظاموں میں فوری ردعمل جیسے چیپیرونز، نیز سست ردعمل جیسے پروٹین کی پیداوار، تاخیر، اور دیگر کو کنٹرول کرنے کے لیے ٹرانسکرپشن ریگولیشن شامل ہو سکتے ہیں۔ تناؤ کے ردعمل کے نظام روگجنک جانداروں کے وائرس میں اہم کردار ادا کر سکتے ہیں۔ ان کے تناؤ کے ردعمل کے نظام، جیسے کہ اویکت حالت میں داخل ہونا، انہیں میزبان یا دیگر ماحول کے اندر دباؤ والے حالات میں زندہ رہنے کی اجازت دے سکتے ہیں۔ ایسے ریگولیٹری نظام موجود ہیں جو درجہ حرارت، پی ایچ، غذائی اجزاء، نمکیات اور آکسیڈیشن میں ہونے والی تبدیلیوں کا جواب دیتے ہیں۔ ردعمل کی سطح ماحول میں ہونے والی تبدیلی کی مقدار پر مبنی ہے۔ تناؤ کے حالات میں تبدیلیاں ہونے پر ردعمل سب سے زیادہ ہوتا ہے، اس صورت میں کنٹرول نیٹ ورکس کو سٹریس رسپانس سسٹم کہا جاتا ہے۔ یہ نظام پروکیریٹس کے اندر بہت ملتے جلتے ہیں اور کچھ نظام، خاص طور پر گرمی کے جھٹکے کا ردعمل، یوکرائٹس اور آثار قدیمہ میں محفوظ ہیں۔ اگرچہ نظام انتہائی ملتے جلتے ہیں، لیکن وہ حالات جن کے تحت وہ فعال ہوتے ہیں ایک جاندار سے دوسرے جاندار میں بہت مختلف ہوتے ہیں۔ وہ نظام جو ماحولیاتی تبدیلی کے ردعمل کو چالو کرتے ہیں ان میں بہت سے کنٹرول عناصر ہوتے ہیں۔ یہ کنٹرول عناصر ایک جین کے لیے مخصوص ہو سکتے ہیں یا وہ جین کے ایک بڑے گروپ کو کنٹرول کر سکتے ہیں۔ جب کنٹرول عناصر جین کے ایک بڑے گروپ کو کنٹرول کرتے ہیں تو اسے ریگولن کہا جاتا ہے۔ ایک ریگولن جینوں کا ایک گروپ ہے جو سب ایک ہی کنٹرول پیٹرن کے ذریعہ ریگولیٹ ہوتے ہیں۔ محرک وہ تمام جین ہیں جو ایک ہی حالت پر ردعمل ظاہر کرتے ہیں۔ کنٹرول عناصر مختلف ماحولیاتی حالات کے دوران جین کے اظہار کو بھی منظم کرتے ہیں جن میں بھوک، اسپورولیشن اور دیگر شامل ہیں۔
بیکٹیریل ٹیکسونومی/ بیکٹیریل ٹیکسونومی:
بیکٹیریل درجہ بندی درجہ بندی ہے، یعنی بیکٹیریا کی درجہ بندی پر مبنی درجہ بندی۔ کارل لینیس کے ذریعہ قائم کردہ سائنسی درجہ بندی میں، ہر ایک پرجاتی کو ایک جینس (بائنری ناموں) کو تفویض کرنا پڑتا ہے، جس کے نتیجے میں درجات کے درجہ بندی کی نچلی سطح ہوتی ہے (خاندان، ماتحت، ترتیب، ذیلی طبقے، طبقے، تقسیم/فائلا، سلطنت اور ڈومین)۔ زندگی کی فی الحال قبول شدہ درجہ بندی میں، تین ڈومینز ہیں (یوکریوٹس، بیکٹیریا اور آرکیا)، جو کہ درجہ بندی کے لحاظ سے، انہی اصولوں پر عمل کرنے کے باوجود ان کے درمیان اور ان کی ذیلی تقسیموں کے درمیان کئی مختلف کنونشنز ہیں کیونکہ ان کا مطالعہ مختلف شعبوں کے ذریعے کیا جاتا ہے۔ نباتیات، حیوانیات، مائکولوجی اور مائکرو بایولوجی)۔ مثال کے طور پر، حیوانیات میں قسم کے نمونے ہوتے ہیں، جبکہ مائکرو بایولوجی میں قسم کے تناؤ ہوتے ہیں۔
بیکٹیریل تھراپی/ بیکٹیریل تھراپی:
بیکٹیریل تھراپی بیماریوں کے علاج کے لیے بیکٹیریا کا علاج معالجہ ہے۔ بیکٹیریل علاج زندہ دوائیں ہیں، اور یہ جنگلی قسم کے بیکٹیریا (اکثر پروبائیوٹکس کی شکل میں) یا بیکٹیریا ہو سکتے ہیں جن کو جینیاتی طور پر علاج کی خصوصیات رکھنے کے لیے انجینیئر کیا گیا ہے جو کہ مریض میں انجکشن لگایا جاتا ہے۔ زندہ ادویات کی دیگر مثالوں میں سیلولر علاج (بشمول امیونو تھراپیٹکس) اور فیج علاج شامل ہیں۔
بیکٹیریل_ٹرانسکرپشن/بیکٹیریل ٹرانسکرپشن:
بیکٹیریل ٹرانسکرپشن وہ عمل ہے جس میں بیکٹیریل ڈی این اے کے ایک حصے کو انزائم آر این اے پولیمریز کے استعمال کے ساتھ میسنجر آر این اے (ایم آر این اے) کے نئے ترکیب شدہ اسٹرینڈ میں کاپی کیا جاتا ہے۔ یہ عمل تین اہم مراحل میں ہوتا ہے: شروع کرنا، بڑھانا، اور ختم کرنا؛ اور حتمی نتیجہ ایم آر این اے کا ایک اسٹرینڈ ہے جو ڈی این اے کے ایک اسٹرینڈ کا تکمیلی ہے۔ عام طور پر، نقل شدہ خطہ ایک سے زیادہ جین کے لیے ہوتا ہے۔ درحقیقت، بہت سے پراکاریوٹک جینز اوپیرونز میں پائے جاتے ہیں، جو کہ جینوں کا ایک سلسلہ ہے جو ایک ہی پروٹین یا جین کی مصنوعات کے لیے کوڈ کرنے کے لیے مل کر کام کرتے ہیں اور ایک ہی پروموٹر کے ذریعے کنٹرول کیا جاتا ہے۔ بیکٹیریل RNA پولیمریز چار ذیلی یونٹوں پر مشتمل ہوتا ہے اور جب پانچواں ذیلی یونٹ منسلک ہوتا ہے، جسے σ-factor کہا جاتا ہے، پولیمریز DNA میں مخصوص پابند ترتیبوں کو پہچان سکتا ہے، جسے پروموٹر کہتے ہیں۔ پروموٹر کے ساتھ σ-فیکٹر کا پابند ہونا آغاز کا پہلا قدم ہے۔ پولیمریز سے σ-فیکٹر کے نکلنے کے بعد، لمبا ہونا آگے بڑھتا ہے۔ پولیمریز ڈبل پھنسے ہوئے DNA کو نیچے جاری رکھتا ہے، اسے کھولتا ہے اور نئے mRNA اسٹرینڈ کو اس وقت تک ترکیب کرتا ہے جب تک کہ یہ ختم ہونے والی جگہ پر نہ پہنچ جائے۔ ختم کرنے کے دو میکانزم ہیں جن پر ذیل میں مزید تفصیل سے بات کی گئی ہے۔ جین کے مناسب اظہار کے لیے مخصوص جگہوں پر ختم کرنا ضروری ہے۔ جین کا اظہار اس بات کا تعین کرتا ہے کہ جین کی کتنی مصنوعات، جیسا کہ پروٹین، جین کے ذریعے بنائی گئی ہے۔ ٹرانسکرپشن آر این اے پولیمریز کے ذریعہ کی جاتی ہے لیکن اس کی خصوصیت کو ترتیب سے مخصوص ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین کے ذریعہ کنٹرول کیا جاتا ہے جسے ٹرانسکرپشن عوامل کہتے ہیں۔ ٹرانسکرپشن کے عوامل مخصوص ڈی این اے کی ترتیب کو پہچاننے اور خلیات کی ضروریات کی بنیاد پر اضافی ٹرانسکرپشن کو فروغ دینے یا روکنے کے لیے کام کرتے ہیں۔ بیکٹیریل ٹرانسکرپشن کئی طریقوں سے یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشن سے مختلف ہے۔ بیکٹیریا میں، نقل اور ترجمہ سیل کے سائٹوپلازم میں بیک وقت ہو سکتا ہے، جب کہ یوکرائٹس میں ٹرانسکرپشن نیوکلئس میں ہوتا ہے اور ترجمہ سائٹوپلازم میں ہوتا ہے۔ بیکٹیریل آر این اے پولیمریز کی صرف ایک قسم ہے جبکہ یوکرائٹس کی 3 اقسام ہیں۔ بیکٹیریا میں ایک σ-عنصر ہوتا ہے جو پروموٹر سائٹس کا پتہ لگاتا ہے اور اس سے منسلک ہوتا ہے لیکن یوکرائٹس کو σ-فیکٹر کی ضرورت نہیں ہوتی ہے۔ اس کے بجائے، eukaryotes میں ٹرانسکرپشن کے عوامل ہوتے ہیں جو پروموٹر سائٹس کی شناخت اور پابند ہونے کی اجازت دیتے ہیں۔ مجموعی طور پر، بیکٹیریا کے اندر ٹرانسکرپشن ایک انتہائی منظم عمل ہے جسے ایک مقررہ وقت میں بہت سے سگنلز کے انضمام سے کنٹرول کیا جاتا ہے۔ بیکٹیریا پروٹین پیدا کرنے کے لیے نقل اور ترجمے پر بہت زیادہ انحصار کرتے ہیں جو انہیں اپنے ماحول کے لیے خاص طور پر جواب دینے میں مدد کرتے ہیں۔
بیکٹیریل_ٹرانسلیشن/ بیکٹیریل ترجمہ:
بیکٹیریل ٹرانسلیشن وہ عمل ہے جس کے ذریعے میسنجر آر این اے کا بیکٹیریا میں پروٹین میں ترجمہ کیا جاتا ہے۔
بیکٹیریل وگینوسس/ بیکٹیریل وگینوسس:
بیکٹیریل وگینوسس (BV) اندام نہانی کی ایک بیماری ہے جو بیکٹیریا کی ضرورت سے زیادہ نشوونما کی وجہ سے ہوتی ہے۔ عام علامات میں اندام نہانی سے خارج ہونے والے مادہ میں اضافہ ہوتا ہے جو اکثر مچھلی جیسی بو آتی ہے۔ خارج ہونے والا مادہ عام طور پر سفید یا سرمئی رنگ کا ہوتا ہے۔ پیشاب کے ساتھ جلن ہو سکتی ہے۔ خارش غیر معمولی ہے۔ کبھی کبھار، کوئی علامات نہیں ہوسکتے ہیں. BV ہونا ایچ آئی وی/ایڈز سمیت متعدد جنسی طور پر منتقل ہونے والے انفیکشن کے انفیکشن کے خطرے کو تقریباً دوگنا کردیتا ہے۔ یہ حاملہ خواتین میں قبل از وقت پیدائش کا خطرہ بھی بڑھاتا ہے۔ بی وی اندام نہانی میں قدرتی طور پر پائے جانے والے بیکٹیریا کے عدم توازن کی وجہ سے ہوتا ہے۔ بیکٹیریا کی سب سے عام قسم میں تبدیلی اور موجود بیکٹیریا کی کل تعداد میں سو سے ہزار گنا اضافہ ہوتا ہے۔ عام طور پر، Lactobacilli کے علاوہ دیگر بیکٹیریا زیادہ عام ہو جاتے ہیں۔ خطرے کے عوامل میں ڈوچنگ، نئے یا ایک سے زیادہ جنسی شراکت دار، اینٹی بائیوٹکس، اور انٹرا یوٹرن ڈیوائس کا استعمال شامل ہیں۔ تاہم، اسے جنسی طور پر منتقل ہونے والا انفیکشن نہیں سمجھا جاتا ہے۔ علامات کی بنیاد پر تشخیص مشتبہ ہے، اور اندام نہانی کے خارج ہونے والے مادہ کی جانچ کرکے اور عام اندام نہانی پی ایچ سے زیادہ، اور بڑی تعداد میں بیکٹیریا تلاش کرکے اس کی تصدیق کی جاسکتی ہے۔ BV اکثر اندام نہانی کے خمیر کے انفیکشن یا Trichomonas کے انفیکشن سے الجھ جاتا ہے۔ عام طور پر علاج ایک اینٹی بائیوٹک سے ہوتا ہے، جیسے clindamycin یا metronidazole۔ یہ ادویات حمل کے دوسرے یا تیسرے سہ ماہی میں بھی استعمال کی جا سکتی ہیں۔ تاہم، حالت اکثر علاج کے بعد دوبارہ آتی ہے. پروبائیوٹکس دوبارہ ہونے سے روکنے میں مدد کرسکتے ہیں۔ یہ واضح نہیں ہے کہ آیا پروبائیوٹکس یا اینٹی بائیوٹکس کا استعمال حمل کے نتائج کو متاثر کرتا ہے۔ کسی بھی وقت متاثرہ خواتین کا تناسب 5% اور 70% کے درمیان ہوتا ہے۔ BV افریقہ کے کچھ حصوں میں سب سے زیادہ عام ہے اور ایشیا اور یورپ میں کم عام ہے۔ ریاستہائے متحدہ میں 14 سے 49 سال کی عمر کے درمیان تقریباً 30 فیصد خواتین متاثر ہیں۔ کسی ملک کے اندر نسلی گروہوں کے درمیان قیمتیں کافی حد تک مختلف ہوتی ہیں۔ اگرچہ BV جیسی علامات کو ریکارڈ شدہ تاریخ کے بیشتر حصے میں بیان کیا گیا ہے، پہلا واضح طور پر دستاویزی کیس 1894 میں پیش آیا۔
بیکٹیریل وِلٹ/ بیکٹیریل مرجھا جانا:
بیکٹیریل وِلٹ بیماریوں کا ایک کمپلیکس ہے جو پودوں میں پائے جاتے ہیں جیسے Cucurbitaceae اور Solanaceae (ٹماٹر، عام پھلیاں وغیرہ) اور یہ پیتھوجینز Erwinia tracheiphila، ایک گرام منفی بیکٹیریم، یا Curtobacterium flaccumfaciens pv کی وجہ سے ہوتے ہیں۔ flaccumfaciens، ایک گرام مثبت بیکٹیریم۔ ککڑی اور مسک میلون کے پودے سب سے زیادہ حساس ہیں، لیکن اسکواش، کدو اور لوکی بھی متاثر ہو سکتے ہیں۔
بیکٹیریل_ولٹ_آف_کارنیشن/کارنیشن کا بیکٹیریل مرجھا جانا:
بیکٹیریل وِلٹ آف کارنیشنز ایک جراثیمی بیماری ہے جو پودوں کے روگجن Paraburkholderia caryophylli کی وجہ سے ہوتی ہے (اکثر اسے Burkholderia caryophylli کہا جاتا ہے)۔ اس سے پہلے، Pseudomonas caryophilli کے نام سے، پیتھوجین ایک ایروبک گرام منفی بیکٹیریا ہے جو صرف زخموں کے ذریعے اپنے میزبان میں داخل ہونے کے قابل ہونے کے لیے جانا جاتا ہے۔ ایک بار میزبان کے اندر، یہ عروقی نظام اور جڑوں کو نوآبادیات بناتا ہے جس کی وجہ سے اندرونی تنے کا ٹوٹ جانا، پتوں کا پیلا ہونا، مرجھانا، اور ناسوروں کی نشوونما ہوتی ہے۔ ایک جراثیمی بیماری کے طور پر، بیکٹیریل وِلٹ آف کارنیشنز کو بیکٹیریل سٹریمنگ، اور بیکٹیریل اوز جیسی علامات سے بھی نمایاں کیا جا سکتا ہے۔
ٹرف گراس کا بیکٹیریل وِلٹ/ٹرف گراس کا بیکٹیریل مرجھا جانا:
ٹرف گراس کا بیکٹیریل وِلٹ ٹرف کی واحد معروف بیکٹیریل بیماری ہے۔ کازل ایجنٹ گرام منفی بیکٹیریم Xanthomonas campestris pv ہے۔ گرامینی ٹرف کے بیکٹیریل مرجھانے کا پہلا کیس رینگنے والے بینٹ گراس کی ایک کھیتی میں رپورٹ کیا گیا تھا جسے ٹورنٹو یا C-15 کہا جاتا ہے، جو پورے امریکہ میں پایا جاتا ہے۔ جب تک کہ 1984 میں اسباب کی نشاندہی نہیں کی گئی تھی، اس بیماری کو صرف C-15 کمی کے طور پر کہا جاتا تھا۔ یہ بیماری تقریباً خاص طور پر گولف کورسز میں سبزیاں ڈالنے پر پائی جاتی ہے جہاں وسیع تر کٹائی گھاس میں زخم پیدا کرتی ہے جسے پیتھوجین میزبان میں داخل ہونے اور بیماری پیدا کرنے کے لیے استعمال کرتا ہے۔
بیکٹیریاسٹرم/بیکٹیریاسٹرم:
بیکٹیریاسٹرم خاندان Chaetocerotaceae میں ڈائیٹمس کی ایک جینس ہے۔ جینس بیکٹیریاسٹرم میں 30 سے ​​زیادہ بیان کردہ انواع ہیں، لیکن ان میں سے بہت سی کو فی الحال قبول نہیں کیا گیا ہے، اور نئی نسلیں اب بھی جینس میں شامل کی گئی ہیں۔ جینس کے لئے قسم کی قسم بیکٹیریاسٹرم فرکیٹم شیڈبولٹ ہے۔
بیکٹیریاسٹرم ڈیلیکیٹولم/بیکٹیریاسٹرم ڈیلیکیٹولم:
بیکٹیریاسٹرم ڈیلیکیٹولم بیکٹیریاسٹرم جینس میں ایک ڈائیٹم ہے۔
بیکٹیریسرا/بیکٹریسیرا:
Bactericera خاندان Triozidae میں ایک psyllid بگ جینس ہے.
Bactericera_albiventris/Bactericera albiventris:
Bactericera albiventris خاندان Triozidae میں ایک hemipteran بگ ہے، جو ولو (سیلکس پرجاتیوں) کے پتوں پر گلے کا سبب بنتا ہے۔ اسے پہلی بار 1848 میں آرنلڈ فرسٹر نے بیان کیا تھا۔
Bactericera_cockerelli/Bactericera cockerelli:
بیکٹیریسیرا کوکریلی، جسے آلو سائلڈ بھی کہا جاتا ہے، سائلڈ کی ایک قسم ہے جو جنوبی شمالی امریکہ میں ہے۔ اس کا دائرہ وسطی امریکہ کے شمال سے لے کر امریکی بحر الکاہل کے شمال مغرب اور منیٹوبا کے کچھ حصوں تک پھیلا ہوا ہے۔ یہ براعظم کے مغربی حصے تک محدود ہے۔ جیسا کہ اس کے نام سے پتہ چلتا ہے، یہ عام طور پر آلو اور ٹماٹر کی فصلوں پر پایا جاتا ہے، لیکن اس کی انواع کی حد ہے جس میں 40 سے زیادہ انواع کے پودوں اور زیادہ سے زیادہ 20 نسلیں شامل ہیں۔ افزائش کے میزبانوں کو عام طور پر بنیادی طور پر Solanaceae تک محدود سمجھا جاتا ہے، جس میں اہم فصل اور عام گھاس کی انواع، اور Convolvulaceae کی چند انواع شامل ہیں، بشمول bindweed اور شکرقندی۔ کچھ پودوں پر، خاص طور پر آلو، اپسرا کو کھانا کھلانے سے سائلڈ یلوز نامی حالت پیدا ہوتی ہے، جسے ٹاکسن کا نتیجہ سمجھا جاتا ہے۔ اپسرا اور بالغ دونوں بیکٹیریم Candidatus Liberibacter کو منتقل کر سکتے ہیں۔ زیبرا چپ آلو کی حال ہی میں تشخیص شدہ بیماری ہے جو سائلڈ انفیکشن سے منسلک ہے اور گرام منفی بیکٹیریم کینڈیڈیٹس لائبیریبیکٹر کی انواع کی وجہ سے ہوتی ہے۔ کندوں میں اکثر رنگت خراب ہوتی ہے جو چپس کو فرائی کرنے کے دوران زیادہ واضح ہو جاتی ہے۔ یہ بیماری کسانوں کو بہت زیادہ نقصان پہنچاتی ہے جب یہ ہوتا ہے کیونکہ آلو چپس یا فرائز بنانے کے لیے موزوں نہیں ہوتے۔ آبادی میں بڑے اضافے کے دوران کیڑوں نے آلو کی پیداوار میں نمایاں نقصان پہنچایا ہے۔ آلو کی پیداوار میں زیادہ سے زیادہ نقصان کا تعلق بڑھتے ہوئے موسم کے اوائل میں، یا موسم گرما میں پتوں کی نمایاں چھت والی فصلوں پر ہونے والے انفیکشن سے ہوتا ہے۔ سائلڈز گرمی کو برداشت نہیں کرتے ہیں اور یہ خیال کیا جاتا ہے کہ وہ موسم گرما میں سایہ دینے کے لیے کافی پتوں کی چھت والی فصلوں میں موسم گرما کے درجہ حرارت میں زندہ رہتے ہیں۔ اپسرا بہت چھوٹی اور غیر واضح ہوتی ہیں، پتوں کے نیچے کی طرف کھانا کھلاتی ہیں۔ اپسرا اور بالغ دونوں فلیم میں کھانا کھاتے ہیں۔ یہ سائیلڈز طویل عرصے سے شمالی امریکہ کے جنوبی علاقوں سے ہر سال شمال کی طرف ہجرت کرنے کے بارے میں سوچتے رہے ہیں، لیکن حالیہ شواہد سے ظاہر ہوتا ہے کہ مختلف آبادی علاقائی طور پر موجود ہے۔
جراثیم کش/بیکٹیرائڈ:
ایک جراثیم کش یا بیکٹیریوسائڈ، بعض اوقات مختصرا Bcidal، ایک مادہ ہے جو بیکٹیریا کو مار ڈالتا ہے۔ جراثیم کش ادویات جراثیم کش، جراثیم کش ادویات، یا اینٹی بایوٹک ہیں۔ تاہم، مادی سطحوں میں جراثیم کش خصوصیات بھی ہو سکتی ہیں جن کی بنیاد صرف ان کی جسمانی سطح کی ساخت پر ہوتی ہے، مثال کے طور پر کیڑوں کے پروں جیسے بایومیٹریلز۔
بیکٹیریڈیلا/بیکٹریڈیلا:
بیکٹیریڈیلا چھوٹے سمندری گھونگوں کی ایک نسل ہے، Pyramidellidae خاندان میں سمندری گیسٹرو پوڈ مولسکس، اہرام اور ان کے اتحادی۔
بیکٹیریڈیم/بیکٹیریڈیم:
بیکٹیریڈیم سمندری گھونگوں کی ایک نسل ہے، پیرامیڈیلیڈی خاندان میں سمندری گیسٹرو پوڈ مولسکس، اہرام اور ان کے اتحادی۔
بیکٹیریڈیم_برموڈینس/بیکٹیریڈیم برموڈینس:
بیکٹیریڈیم برموڈینس سمندری گھونگے کی ایک قسم ہے، پیرامیڈیلیڈی خاندان میں ایک سمندری گیسٹرو پوڈ مولسک، اہرام اور ان کے اتحادی ہیں۔ یہ انواع گیسٹرو پوڈس کی بیکٹیریڈیم جینس کے اندر رہتی ہے، اس کے علاوہ دیگر تین متعلقہ انواع بیکٹیریڈیم کیرینٹم، بیکٹیریڈیم ریسٹیکولم اور بیکٹیریڈیم وٹاٹیم ہیں۔
بیکٹیریڈیم_کیرینیٹم/بیکٹیریڈیم کیرینٹم:
بیکٹیریڈیم کیرینٹم سمندری گھونگھے کی ایک قسم ہے، پیرامیڈیلیڈی خاندان میں ایک سمندری گیسٹرو پوڈ مولسک اور بیکٹیریڈیم جینس۔
بیکٹیریڈیم ریسٹیکولم / بیکٹیریڈیم ریسٹیکولم:
بیکٹیریڈیم ریسٹیکولم سمندری گھونگے کی ایک قسم ہے، پیرامیڈیلیڈی خاندان میں ایک سمندری گیسٹرو پوڈ مولسک، اہرام اور ان کے اتحادی۔ یہ انواع گیسٹرو پوڈس کی بیکٹیریڈیم جینس کے اندر رہتی ہے، اس کے علاوہ دیگر تین متعلقہ انواع بیکٹیریڈیم برموڈینس، بیکٹیریڈیم کیرینٹم اور بیکٹیریڈیم وِٹیٹم ہیں۔
بیکٹیریڈیم وٹیٹم/بیکٹیریڈیم وٹیٹم:
بیکٹیریڈیم وِٹاٹم سمندری گھونگوں کی ایک قسم ہے، پیرامیڈیلیڈی خاندان میں ایک سمندری گیسٹرو پوڈ مولسک، اہرام اور ان کے اتحادی۔ یہ انواع بیکٹیریڈیم برموڈینس، بیکٹیریڈیم کیرینٹم اور بیکٹیریڈیم ریسٹیکولم کے ساتھ گیسٹرو پوڈ جینس بیکٹیریڈیم سے تعلق رکھتی ہے۔
بیکٹیریوکلوروفیل/بیکٹریوکلوروفیل:
بیکٹیریوکلوروفیلس (BChl) فوٹو سنتھیٹک روغن ہیں جو مختلف فوٹوٹروفک بیکٹیریا میں پائے جاتے ہیں۔ انہیں 1932 میں CB وان نیل نے دریافت کیا تھا۔ ان کا تعلق کلوروفل سے ہے، جو پودوں، طحالب اور سیانو بیکٹیریا میں بنیادی روغن ہیں۔ وہ جاندار جن میں بیکٹیریوکلوروفیل ہوتا ہے وہ اپنی توانائی کی ضروریات کو برقرار رکھنے کے لیے فوٹو سنتھیس کا عمل کرتے ہیں، لیکن ایک ضمنی پیداوار کے طور پر آکسیجن پیدا نہیں کرتے ہیں۔ وہ روشنی کی طول موج کا استعمال کرتے ہیں جو پودوں یا سیانوبیکٹیریا کے ذریعے جذب نہیں ہوتے ہیں۔ Mg2+ کو پروٹون کے ساتھ تبدیل کرنے سے بیکٹیریو فائیو فائٹن (BPh) ملتا ہے، جو فیو فائٹین کی شکل ہے۔ کچھ بیکٹیریو کلوروفیلز کی ساخت
بیکٹیریاسن/بیکٹیریاسن:
بیکٹیریوسنز پروٹیناسیئس یا پیپٹیڈک ٹاکسن ہیں جو بیکٹیریا کے ذریعہ تیار کیے جاتے ہیں تاکہ اسی طرح کے یا قریب سے متعلق بیکٹیریل تناؤ کی نشوونما کو روک سکے۔ وہ خمیر اور پیرامیشیم قتل کرنے والے عوامل سے ملتے جلتے ہیں، اور ساختی، فعال اور ماحولیاتی طور پر متنوع ہیں۔ بیکٹیریوسن کی ایپلی کیشنز کو تنگ اسپیکٹرم اینٹی بائیوٹکس کے طور پر ان کے استعمال کا اندازہ لگانے کے لیے ٹیسٹ کیا جا رہا ہے۔ بیکٹیریوسن پہلی بار 1925 میں آندرے گریٹیا نے دریافت کیے تھے۔ وہ بیکٹیریا کو مارنے کے طریقے تلاش کرنے کے عمل میں شامل تھے، جس کے نتیجے میں اینٹی بایوٹک کی نشوونما بھی ہوئی۔ بیکٹیریوفیج کی دریافت، یہ سب کچھ چند سالوں میں۔ اس نے اپنی پہلی دریافت کو کولیسین کا نام دیا کیونکہ اس نے ای کولی کو ہلاک کیا۔
Bacteriocin_IId/Bacteriocin IId:
بیکٹیریوسن AS-48 ایک سائیکلک پیپٹائڈ اینٹی بائیوٹک ہے جو eubacteria Enterococcus faecalis (Streptococcus faecalis) کے ذریعہ تیار کیا جاتا ہے جو گرام مثبت اور گرام منفی دونوں بیکٹیریا کے خلاف ایک وسیع اینٹی مائکروبیل سپیکٹرم کو ظاہر کرتا ہے۔ بیکٹیریوسن AS-48 کو فیرومون ریسپانسیو پلاسمڈ pMB2 کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے، اور یہ پلازما جھلی پر کام کرتا ہے جس میں یہ سوراخوں کو کھولتا ہے جس سے آئن کا اخراج اور سیل کی موت ہوتی ہے۔ بیکٹیریوسن AS-48 کا گلوبلولر ڈھانچہ ہائیڈروفوبک کور کو گھیرے ہوئے پانچ الفا ہیلیکس پر مشتمل ہے۔ T اور قدرتی قاتل خلیوں کے ممالیہ NK-lysin انفیکٹر پروٹین کی ساخت ایک جیسی ہے، حالانکہ اس میں bacteriocins AS-48 کے ساتھ ترتیب ہومولوجی کی کمی ہے۔ بیکٹیریوسن حساس خلیات کے مینوز فاسفوٹرانسفریز سسٹم (مین پی ٹی ایس) کے اجزاء کو ہدف/رسیپٹر کے طور پر استعمال کرتا ہے۔ مدافعتی پروٹین LciA ریسیپٹر پروٹین اور بیکٹیریوسن کے ساتھ ایک مضبوط کمپلیکس بناتا ہے، اس طرح خلیات کو ہلاک ہونے سے روکتا ہے۔ LciA اور man-PTS اجزاء (IIAB, IIC، اور IID) کے درمیان کمپلیکس میں ایک آن-آف قسم کا طریقہ کار شامل ہوتا ہے جو صرف بیکٹیریوسن کی موجودگی میں پیچیدہ تشکیل کی اجازت دیتا ہے۔ بصورت دیگر LciA اور رسیپٹر پروٹین کے درمیان کوئی کمپلیکس نہیں دیکھا گیا۔
بیکٹیریوسینوجن/بیکٹیریوسینوجین:
بیکٹیریوسائنوجنز (bāk-tēr'ē-ə-sĭn'ə-jənz)، جسے بیکٹیریوینوجینک پلاسمیڈ بھی کہا جاتا ہے، بیکٹیریائی پلاسمیڈ ہیں جو بیکٹیریا کی ترکیب کو ہدایت کرتے ہیں، بیکٹیریا کی مخصوص قسموں کے ذریعہ تیار کردہ بیکٹیریوسائڈل پروٹین جو ایک ہی قسم کے دیگر تناؤ کو مارتے ہیں۔ قریب سے متعلقہ پرجاتیوں. عام طور پر بیکٹیریوینوجن کو دبایا جاتا ہے اور اس کا بیکٹیریوسن پیدا نہیں ہوتا ہے، لیکن بعض حالات میں پلاسمڈ کو پیچیدہ اور ناقص طور پر سمجھے جانے والے انداز میں دبایا جاتا ہے۔
بیکٹیریوسائٹ/بیکٹیریوسائٹ:
ایک بیکٹیریوسائٹ (بیکٹیریا سیل کے لیے یونانی)، جسے مائیسیٹوسائٹ بھی کہا جاتا ہے، ایک خصوصی ایڈیپوسائٹ ہے جو بنیادی طور پر بعض حشرات کے گروہوں میں پایا جاتا ہے جیسے aphids، tsetse مکھی، جرمن کاکروچ، weevils۔ ان خلیوں میں بیکٹیریا اور فنگس جیسے اینڈوسیمبیٹک جاندار ہوتے ہیں، جو اپنے میزبان کو ضروری امینو ایسڈ اور دیگر کیمیکل فراہم کرتے ہیں۔ بیکٹیریوسائٹس ایک خاص عضو میں جمع ہو سکتے ہیں جسے بیکٹیریوم کہتے ہیں۔ مائکروجنزموں کے ساتھ Endosymbiosis کیڑوں میں عام ہے۔ حشرات کی 10% سے زیادہ نسلیں اپنی نشوونما اور بقا کے لیے انٹرا سیلولر بیکٹیریا پر انحصار کرتی ہیں۔ Endosymbionts اور ان کے میزبانوں کے ساتھ تعلقات فنکشنل اور جینیاتی طور پر متنوع ہیں۔ تاہم، میزبان سیل جس میں بیکٹیریل اور فنگل اینڈوسیمبیونٹس رہتے ہیں زیادہ تر نامعلوم ہے۔
بیکٹیریو فیریٹین / بیکٹیریو فیریٹین:
Bacterioferritin (Bfr) ایک اولیگومرک پروٹین ہے جس میں بائنوکلیئر آئرن سینٹر اور ہیم بی دونوں ہوتے ہیں۔ Bfr کی ترتیری اور چوتھائی ساخت فیریٹین سے بہت ملتی جلتی ہے۔ بی ایف آر کے جسمانی افعال، جو صرف لوہے کے استعمال کے علاوہ ہوسکتے ہیں، واضح نہیں ہیں۔ Bfr 12 ہیم گروپس کو شامل کرتے ہوئے 24 یکساں ذیلی یونٹس سے تقریباً کروی، کھوکھلا خول بناتا ہے۔ آئرن کو اس کے مرکزی گہا (تقریباً 80 Å قطر) میں ہائیڈریٹڈ فیرک آکسائیڈ معدنیات کے طور پر ذخیرہ کیا جاتا ہے۔ مجموعی کمپلیکس کیوبک (432) ہم آہنگی ہے۔ ہر ذیلی یونٹ میں ایک بائنوکلیئر میٹل بائنڈنگ سائٹ (ڈائرون سائٹ) شامل ہوتی ہے جو سبونائٹ کے چار بڑے ہیلائسز کو آپس میں جوڑتی ہے، جس کی شناخت فیروکسیڈیز ایکٹو سائٹ کے طور پر کی گئی ہے۔ Pseudomonas aeruginosa (PaBfr) سے Bfr، دیگر Bfrs کے برعکس، دو ذیلی یونٹ اقسام پر مشتمل پایا جاتا ہے، جو اپنے امینو ایسڈ کی ترتیب میں کافی مختلف ہیں۔ اسی طرح کی ہیٹرو اسمبلی اعلی یوکرائٹس کے فیریٹین میں دیکھی جاتی ہے۔ Escherichia coli (EcBfr) سے Bfr جو قدرتی طور پر ساختی عدم استحکام کو ظاہر کرتا ہے اور دو اولیگومرائزیشن ریاستوں کو آباد کرکے ایک نامکمل خود اسمبلی رویے کو کم سے کم پروٹین نینو کیجز کی خود اسمبلی کے مطالعے کے لیے ایک ماڈل کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔ PDB: 1bfr PDB: 1bcf
بیکٹیریوہوپنیپولیول/بیکٹریوہوپانی پولیول:
بیکٹیریاہوپانی پولیولس (BHPs)، بیکٹیریو ہوپینائڈز، یا بیکٹیریل پینٹا سائکلک ٹرائیٹرپینائڈز عام طور پر بہت سے بیکٹیریا کے لپڈ سیل جھلیوں میں پائے جاتے ہیں۔ بی ایچ پی اکثر تلچھٹ کی چٹانوں میں بائیو مارکر کے طور پر استعمال ہوتے ہیں اور یہ قدیم بیکٹیریل کمیونٹیز کے بارے میں paleoecological معلومات فراہم کر سکتے ہیں۔
جراثیمی_پانی_تجزیہ/بیکٹیرولوجیکل پانی کا تجزیہ:
بیکٹیریاولوجیکل پانی کا تجزیہ پانی کا تجزیہ کرنے کا ایک طریقہ ہے جس میں موجود بیکٹیریا کی تعداد کا اندازہ لگایا جاتا ہے اور اگر ضرورت ہو تو یہ معلوم کرنے کے لیے کہ وہ کس قسم کے بیکٹیریا ہیں۔ یہ پانی کے معیار کے ایک پہلو کی نمائندگی کرتا ہے۔ یہ ایک مائیکرو بائیولوجیکل تجزیاتی طریقہ کار ہے جس میں پانی کے نمونے استعمال ہوتے ہیں اور ان نمونوں سے بیکٹیریا کے ارتکاز کا تعین کیا جاتا ہے۔ اس کے بعد ان ارتکاز سے پانی کے استعمال کے لیے موزوں ہونے کے بارے میں اندازہ لگانا ممکن ہے۔ یہ عمل، مثال کے طور پر، معمول کے مطابق اس بات کی تصدیق کے لیے استعمال کیا جاتا ہے کہ پانی انسانی استعمال کے لیے محفوظ ہے یا نہانے اور تفریحی پانی استعمال کرنے کے لیے محفوظ ہیں۔ مختلف پانیوں کے لیے تشریح اور کارروائی کے محرک کی سطح پانی کے استعمال کے لحاظ سے مختلف ہوتی ہے۔ جب کہ پینے کے پانی پر بہت سخت سطحیں لاگو ہوتی ہیں، زیادہ آرام دہ سطحیں سمندری نہانے والے پانیوں پر لاگو ہوتی ہیں، جہاں صارفین کی طرف سے پانی کی بہت کم مقدار میں کھانے کی توقع کی جاتی ہے۔
بیکٹیریاولوجسٹ/بیکٹریالوجسٹ:
ایک بیکٹیریاولوجسٹ ایک مائکرو بایولوجسٹ یا بیکٹیریاولوجی میں تربیت یافتہ پیشہ ور ہے، مائکرو بایولوجی کی ایک ذیلی تقسیم۔ بیکٹیریاولوجسٹ کے فرائض میں بیماریوں کی روک تھام، تشخیص اور تشخیص کے ساتھ ساتھ صحت کی دیکھ بھال بھی شامل ہے، اور وہ مختلف کام انجام دے سکتے ہیں جیسے کہ وبائی امراض کی نگرانی، بائیو ٹیکنالوجی کی ترقی کے ساتھ کوالٹی آڈیٹنگ، بنیادی تحقیق، انتظام اور کیریئر سے متعلق تدریس، سائنسدان۔ انتظام، لیبارٹری کوآرڈینیشن اور بلڈ بینک۔
بیکٹیریاولوجی/بیکٹریالوجی:
بیکٹیریاولوجی حیاتیات کی وہ شاخ اور خاصیت ہے جو بیکٹیریا کی مورفولوجی، ماحولیات، جینیات اور حیاتیاتی کیمیا کے ساتھ ساتھ ان سے متعلق بہت سے دوسرے پہلوؤں کا مطالعہ کرتی ہے۔ مائکرو بایولوجی کی اس ذیلی تقسیم میں بیکٹیریل پرجاتیوں کی شناخت، درجہ بندی اور خصوصیات شامل ہیں۔ بیکٹیریا کے علاوہ دیگر مائکروجنزموں کے ساتھ سوچنے اور کام کرنے کی مماثلت کی وجہ سے، جیسا کہ پروٹوزوا، فنگس، اور وائرس، بیکٹیریاولوجی کے شعبے میں مائیکرو بایولوجی کے طور پر توسیع کرنے کا رجحان رہا ہے۔ اصطلاحات پہلے اکثر ایک دوسرے کے بدلے استعمال ہوتی تھیں۔ تاہم، بیکٹیریاولوجی کو ایک الگ سائنس کے طور پر درجہ بندی کیا جا سکتا ہے۔
بیکٹیریولیسن/بیکٹیریولیسن:
سیرم کے مادوں میں سے ایک جو بیکٹیریا کی تحلیل کے عمل کا حصہ ہے، انزائمز بیکٹیریل سیل وال کی تحلیل کو فروغ دیں گے اور بیکٹیریا کی موت کا سبب بنیں گے۔ بیکٹیریولیسن غالباً گرام پازیٹو بیکٹیریا میں لیپوٹیچوک ایسڈ (LTA) اور گرام منفی بیکٹیریا میں فاسفولیپڈس کو ڈی ریگولیٹ کرکے کام کرتا ہے۔
بیکٹیریوم/بیکٹریوم:
ایک بیکٹیریوم ایک مخصوص عضو ہے، جو بنیادی طور پر کچھ کیڑوں میں پایا جاتا ہے، جو اینڈوسیبیوٹک بیکٹیریا کی میزبانی کرتا ہے۔ بیکٹیریوم میں مخصوص خلیات ہوتے ہیں، جنہیں بیکٹیریوسائٹس کہتے ہیں، جو میزبان جانور کی حفاظت کرتے ہوئے بیکٹیریا کو غذائی اجزاء اور پناہ گاہ فراہم کرتے ہیں۔ بدلے میں، بیکٹیریا میزبان کیڑے کو وٹامنز اور امینو ایسڈ جیسی ضروری چیزیں فراہم کرتے ہیں۔ بیکٹیریوم میزبان کے مدافعتی نظام سے بھی بیکٹیریا کی حفاظت کرتے ہیں، کیڑے جراثیم کش پیپٹائڈس کو چھپاتے ہیں جیسے کہ کولیوپٹیرسن کو بیکٹیریا کو بیکٹیریا کے اندر رکھنے کے لیے بھیولوں کے ذریعے خفیہ کیا جاتا ہے۔ کچھ کیڑے، جیسے شیشے والے پروں والے شارپ شوٹر، بیکٹیریا کی ایک سے زیادہ اقسام کی میزبانی کرتے ہیں۔ بکتر بند کیڑوں میں، بیکٹیریا منفرد جینیاتی اور جنسی خصوصیات رکھتے ہیں۔ مثال کے طور پر، ان کے پاس ہر کروموسوم کی پانچ کاپیاں ہوتی ہیں- بشمول ماں کے مکمل جینوم کی دو کاپیاں۔]
بیکٹیریوفیج/بیکٹریوفیج:
ایک بیکٹیریوفیج () جسے غیر رسمی طور پر فیج () بھی کہا جاتا ہے، ایک وائرس ہے جو بیکٹیریا اور آثار قدیمہ کے اندر متاثر اور نقل کرتا ہے۔ یہ اصطلاح "بیکٹیریا" اور یونانی φαγεῖν (phagein) سے ماخوذ ہے، جس کا مطلب ہے "کھانا"۔ بیکٹیریوفیجز ایسے پروٹینوں پر مشتمل ہوتے ہیں جو ڈی این اے یا آر این اے جینوم کو سمیٹتے ہیں، اور ان کی ساختیں ہو سکتی ہیں جو یا تو سادہ یا وسیع ہیں۔ ان کے جینومز کم سے کم چار جینز (مثلاً MS2) اور زیادہ سے زیادہ سینکڑوں جینز کو انکوڈ کر سکتے ہیں۔ فیجز اپنے جینوم کے سائٹوپلازم میں انجیکشن کے بعد بیکٹیریم کے اندر نقل کرتے ہیں۔ بایوسفیر میں بیکٹیریوفیجز سب سے زیادہ عام اور متنوع ہستیوں میں سے ہیں۔ بیکٹیریوفیجز ہر جگہ موجود وائرس ہیں، جہاں بھی بیکٹیریا موجود ہوتے ہیں۔ ایک اندازے کے مطابق کرہ ارض پر 1031 سے زیادہ بیکٹیریوفیجز ہیں، جو کہ بیکٹیریا سمیت زمین پر موجود ہر دوسرے جاندار سے زیادہ ہیں۔ وائرس دنیا کے سمندروں کے پانی کے کالم میں سب سے زیادہ پائی جانے والی حیاتیاتی ہستی ہیں، اور پروکیریٹس کے بعد بائیو ماس کا دوسرا سب سے بڑا جزو ہے، جہاں سطح پر مائکروبیل چٹائیوں میں 9x108 virions فی ملی لیٹر تک پائے گئے ہیں، اور 70% تک سمندری بیکٹیریا phages سے متاثر ہو سکتے ہیں۔ 20ویں صدی کے آخر سے سابقہ ​​سوویت یونین اور وسطی یورپ کے ساتھ ساتھ فرانس میں Phages کو اینٹی بائیوٹک کے متبادل کے طور پر استعمال کیا جا رہا ہے۔ انہیں بہت سے بیکٹیریا کے ملٹی ڈرگ ریزسٹنٹ اسٹرینز کے خلاف ممکنہ علاج کے طور پر دیکھا جاتا ہے (فیج تھراپی دیکھیں)۔ فیجز مدافعتی نظام کے ساتھ بالواسطہ طور پر فیز انکوڈڈ پروٹینز کے بیکٹیری اظہار کے ذریعے اور براہ راست پیدائشی قوت مدافعت اور بیکٹیریل کلیئرنس کو متاثر کرنے کے لیے جانا جاتا ہے۔
Bacteriophage_AP205/Bacteriophage AP205:
Bacteriophage AP205 ایک بیکٹیریوفیج ہے جو Acinetobacter بیکٹیریا کو متاثر کرتا ہے۔ مثبت واحد پھنسے ہوئے RNA کے جینوم لکیری پر مشتمل ہے۔ بیکٹیریوفیج کا تعلق Duinviridae خاندان کی Apeevirus نسل سے ہے اور یہ خاندان کی قسم ہے۔
Bacteriophage_Giles/Bacteriophage Giles:
جائلز ایک بیکٹیریوفیج ہے جو مائکوبیکٹیریم smegmatis بیکٹیریا کو متاثر کرتا ہے۔ اس فیج کا جینوم دیگر مائکوبیکٹیریوفیجز سے بہت مختلف ہے اور انتہائی موزیک ہے۔ اس کے نصف سے زیادہ پیش گوئی شدہ جین ناول ہیں اور دوسری پرجاتیوں میں نہیں دیکھے جاتے ہیں۔
Bacteriophage_MS2/Bacteriophage MS2:
Bacteriophage MS2 (Emesvirus zinderi)، جسے عام طور پر MS2 کہا جاتا ہے، ایک icosahedral، مثبت احساس کا واحد پھنسے ہوئے RNA وائرس ہے جو بیکٹیریم Escherichia coli اور Enterobacteriaceae کے دیگر ارکان کو متاثر کرتا ہے۔ MS2 قریبی تعلق رکھنے والے بیکٹیریل وائرسز کے خاندان کا ایک رکن ہے جس میں بیکٹیریوفیج f2، بیکٹیریوفیج Qβ، R17، اور GA شامل ہیں۔
Bacteriophage_Mu/Bacteriophage Mu:
بیکٹیریوفیج Mu، جسے mu phage یا mu bacteriophage کے نام سے بھی جانا جاتا ہے، Myoviridae خاندان کا ایک میووائرس (اپنی قسم کی پہلی شناخت) ہے جس کو جینیاتی تبدیلی کا سبب دکھایا گیا ہے۔ یہ خاص اہمیت کا حامل ہے کیونکہ لیری ٹیلر کے ذریعہ Escherichia coli میں اس کی دریافت جینوم میں داخل کرنے والے عناصر کے پہلے مشاہدات میں سے تھی۔ اس دریافت نے دنیا کو ٹرانسپوز ایبل عناصر اور حیاتیات کی وسیع اقسام پر ان کے اثرات کی تحقیقات کے لیے کھول دیا۔ جبکہ Mu خاص طور پر تحقیق کے کئی الگ الگ شعبوں میں شامل تھا (بشمول ای کولی، مکئی، اور ایچ آئی وی)، منتقلی اور داخل کرنے کے وسیع مضمرات نے جینیات کے پورے شعبے کو تبدیل کر دیا۔
بیکٹیریوفیج_پی2/بیکٹریوفیج P2:
بیکٹیریوفیج P2، سائنسی نام Escherichia virus P2، ایک معتدل فیز ہے جو E. coli کو متاثر کرتا ہے۔ یہ ایک دم والا وائرس ہے جس میں سکڑاؤ والی میان ہے اور اس طرح اس کی درجہ بندی پیڈووائرس (سابقہ ​​​​P2likevirus)، ذیلی فیملی Peduovirinae، خاندان Myoviridae کے آرڈر Caudovirales میں کی گئی ہے۔ وائرس کی اس جینس میں بہت سے P2 جیسے فیز کے ساتھ ساتھ سیٹلائٹ فیز P4 بھی شامل ہیں۔
بیکٹیریوفیج_پی بی سی 1/ بیکٹیریوفیج پی بی سی 1:
بیکٹیریوفیج پی بی سی 1 ایک بیکٹیریوفیج ہے جو بیضہ بنانے والے بیکٹیریم بیکیلس سیریس کو متاثر کرتا ہے۔
Bacteriophage_Qbeta/Bacteriophage Qbeta:
Bacteriophage Qbeta (Qubevirus durum)، جسے عام طور پر Qbeta یا Qβ کہا جاتا ہے، ایک مثبت اسٹرینڈ RNA وائرس ہے جو F-pili والے بیکٹیریا کو متاثر کرتا ہے، عام طور پر Escherichia coli۔ اس کا لکیری جینوم 28 nm کے قطر کے ساتھ ایک icosahedral capsid میں پیک کیا گیا ہے۔ بیکٹیریوفیج Qβ F-pilus کے پہلو سے منسلک ہونے کے بعد اپنے میزبان سیل میں داخل ہوتا ہے۔
Bacteriophage_T12/Bacteriophage T12:
بیکٹیریوفیج T12 ایک بیکٹیریوفیج ہے جو بیکٹیریل انواع Streptococcus pyogenes کو متاثر کرتا ہے۔ یہ Caudovirales (سر کی دم کی ساخت کے ساتھ وائرس) کی ترتیب میں Siphoviridae خاندان کی ایک تجویز کردہ نوع ہے۔ یہ بیکٹیریا کے بے ضرر تناؤ کو ایک وائرل تناؤ میں بدل دیتا ہے۔ اس میں speA جین ہوتا ہے جو erythrogenic toxin A کے لیے کوڈ کرتا ہے۔ speA کو سٹریپٹوکوکل پیوجینک ایکزوٹوکسن A، سکارلیٹ فیور ٹاکسن A، یا یہاں تک کہ اسکارلیٹینل ٹاکسن کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ نوٹ کریں کہ جین "speA" کا نام ترچھا ہے؛ ٹاکسن "speA" کا نام ترچھا نہیں ہے۔ اریتھروجینک ٹاکسن A Streptococcus pyogenes کے ایک بے ضرر، غیر وائرل تناؤ کو لائسوجینی کے ذریعے ایک خطرناک تناؤ میں تبدیل کرتا ہے، ایک زندگی کا دور جو جینوم کی میزبان سیل کا حصہ بننے اور نسلوں تک وہاں مستحکم طور پر برقرار رہنے کی صلاحیت سے خصوصیت رکھتا ہے۔ لائسوجینک لائف سائیکل والے فیز کو ٹمپریٹیٹ فیجز بھی کہا جاتا ہے۔ بیکٹیریوفیج T12، فیملی Siphoviridae کا مجوزہ رکن جس میں متعلقہ speA لے جانے والے بیکٹیریوفیجز شامل ہیں، Streptococcus pyogenes کے تمام speA لے جانے والے فیزز کے لیے بھی ایک پروٹو ٹائپک فیز ہے، یعنی اس کا جینوم S. کے ایسے تمام pyogenes کے جینوم کے لیے پروٹو ٹائپ ہے۔ یہ سرخ رنگ کے بخار کی وجہ کے طور پر اہم مشتبہ ہے، ایک متعدی بیماری جو چھوٹے بچوں کو متاثر کرتی ہے۔
Bacteriophage_experimental_evolution/Bacteriophage تجرباتی ارتقاء:
تجرباتی ارتقاء کے مطالعے احتیاط سے ڈیزائن کیے گئے، تولیدی تجربات کے تحت ارتقائی نظریہ کو جانچنے کا ایک ذریعہ ہیں۔ کافی وقت، جگہ اور پیسے کو دیکھتے ہوئے، کسی بھی جاندار کو تجرباتی ارتقائی مطالعات کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ تاہم، تیزی سے جنریشن کے اوقات، اعلی اتپریورتن کی شرح، بڑی آبادی کے سائز، اور چھوٹے سائز تجربہ گاہ کے تناظر میں تجرباتی مطالعات کی فزیبلٹی کو بڑھاتے ہیں۔ ان وجوہات کی بناء پر، بیکٹیریوفیجز (یعنی وہ وائرس جو بیکٹیریا کو متاثر کرتے ہیں) کو خاص طور پر تجرباتی ارتقائی ماہر حیاتیات پسند کرتے ہیں۔ بیکٹیریوفیجز، اور مائکروبیل جانداروں کو جمود میں منجمد کیا جا سکتا ہے، جس سے آباؤ اجداد سے تیار شدہ تناؤ کا موازنہ کیا جا سکتا ہے۔ مزید برآں، جرثومے خاص طور پر سالماتی حیاتیاتی نقطہ نظر سے لیبل ہوتے ہیں۔ مائکروبیل جانداروں کے جینیاتی مواد میں ہیرا پھیری کرنے کے لیے بہت سے مالیکیولر ٹولز تیار کیے گئے ہیں، اور ان کے چھوٹے جینوم سائز کی وجہ سے، تیار شدہ تناؤ کے مکمل جینوم کو ترتیب دینا معمولی بات ہے۔ لہذا، نئے حالات کے موافقت کے دوران تیار شدہ تناؤ میں عین مطابق سالماتی تبدیلیوں کے لیے موازنہ کیا جا سکتا ہے۔
Bacteriophage_f2/Bacteriophage f2:
بیکٹیریوفیج ایف 2 ایک آئیکوشیڈرل، مثبت احساس کا واحد پھنسے ہوئے آر این اے وائرس ہے جو بیکٹیریم Escherichia coli کو متاثر کرتا ہے۔ اس کا بیکٹیریوفیج MS2 سے گہرا تعلق ہے اور اسی پرجاتیوں کو تفویض کیا گیا ہے۔
بیکٹیریوفیج_پی آر این اے/بیکٹریو فیج پی آر این اے:
بیکٹیریوفیج pRNA ایک ncRNA عنصر ہے۔ لکیری dsDNA وائرس کی نقل کے دوران، وائرل جینوم کو پہلے سے تشکیل شدہ وائرل پروکپسڈ میں پیک کیا جاتا ہے۔ پروکاپسڈ میں ڈی این اے کی پیکنگ کے لیے ایک مالیکیولر موٹر کی ضرورت ہوتی ہے، جو توانائی کے لحاظ سے ناموافق حرکت کو پورا کرنے کے لیے اے ٹی پی کو بطور توانائی استعمال کرتی ہے۔ کچھ بیکٹیریوفیج میں، ایک RNA (pRNA) مالیکیول اس موٹر کا ایک اہم جزو ہوتا ہے۔ پیکیجنگ موٹر کے ساختی تجزیوں نے یہ ثابت کیا ہے کہ pRNA مالیکیول میں پانچ گنا ہم آہنگی ہوتی ہے جب پیشگی سے منسلک ہوتا ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ پی آر این اے کیپسڈ کنیکٹر پروٹین سے منسلک ہے۔ وائرل ڈی این اے کو پیک کرنے کے لیے pRNA کے صرف پہلے 120 اڈے ضروری ہیں۔ پی آر این اے کو دو ڈومینز پر مشتمل کرنے کی تجویز ہے، ایک پہلے 120 اڈوں کے مساوی اور دوسرا بقیہ 50 اڈوں سے۔ جوہری درار ان دو ڈومینز کو جوڑنے والے سنگل اسٹرینڈ والے خطے میں ہوتا ہے۔
بیکٹیریوفیج_سکافولڈنگ_پروٹینز/بیکٹریوفیج اسکافولڈنگ پروٹین:
سالماتی حیاتیات میں، بیکٹیریوفیج سکفولڈنگ پروٹین بیکٹیریوفیج اسمبلی میں شامل پروٹین ہیں۔ میکرو مالیکولر ڈھانچے کی اسمبلی ترتیب شدہ واقعات کے ایک مخصوص راستے سے آگے بڑھتی ہے اور اس میں پروٹینز میں تبدیلیاں شامل ہوتی ہیں جب وہ اسمبلی میں شامل ہوتے ہیں۔ اسمبلی کے عمل کو سہاروں کے پروٹین سے مدد ملتی ہے، جو چیپیرون کے طور پر کام کرتے ہیں۔ بیکٹیریوفیج میں، سکیفولڈنگ پروٹین B اور D پروکیپسڈ کی تشکیل کے لیے ذمہ دار ہیں۔ پروٹین ڈی کی 240 کاپیاں بیرونی سہاروں کی تشکیل کرتی ہیں، جبکہ پروٹین بی کی 60 کاپیاں اندرونی سہاروں کی تشکیل کرتی ہیں۔ سکیفولڈنگ پروٹین ڈی کا کردار وائرل سنگل سٹرینڈڈ آر این اے کی تیاری میں ہے۔
بیکٹیریوفیج_%CF%86Cb5/Bacteriophage φCb5:
بیکٹیریوفیج φCb5 ایک بیکٹیریوفیج ہے جو کاولوبیکٹر بیکٹیریا اور دیگر کیلو بیکٹیریا کو متاثر کرتا ہے۔ بیکٹیریوفیج 1970 میں دریافت ہوا تھا، اس کا تعلق Steitzviridae خاندان کی جینس Cebevirus سے ہے اور یہ خاندان کی قسم ہے۔ بیکٹیریوفیج مٹی، میٹھے پانی کی جھیلوں، ندیوں اور سمندری پانی میں وسیع پیمانے پر تقسیم کیا جاتا ہے، وہ جگہیں جہاں کیلو بیکٹیریا رہتے ہیں اور نمکین ہونے کے لیے حساس ہوسکتے ہیں۔
بیکٹیریوپلینز/بیکٹریوپلین:
بیکٹیریوپلینز Oceanospirillaceae کے خاندان سے ایک بیکٹیریا کی نسل ہے، جس کی ایک معروف نوع (Bacterioplanes sanyensis) ہے۔
Bacterioplanes_sanyensis/Bacterioplanes sanyensis:
Bacterioplanes sanyensis بیکٹیریوپلینز کی نسل سے ایک گرام منفی بیکٹیریم ہے جسے چین میں سانیا میں سیانوبیکٹیریا Spirulina plantensis والے تالاب سے الگ تھلگ کر دیا گیا ہے۔
بیکٹیریوپلانکٹن/بیکٹریوپلانکٹن:
بیکٹیریوپلانکٹن سے مراد پلانکٹن کا وہ بیکٹیریل جزو ہے جو پانی کے کالم میں بہتا ہے۔ یہ نام قدیم یونانی لفظ πλανκτος (planktos) سے آیا ہے، جس کا مطلب ہے "آوارہ" یا "آگنے والا"، اور بیکٹیریم، ایک لاطینی اصطلاح جو 19ویں صدی میں کرسچن گوٹ فرائیڈ ایہرنبرگ نے بنائی تھی۔ یہ سمندری اور میٹھے پانی دونوں میں پائے جاتے ہیں۔ بیکٹریوپلانکٹن سمندری اور آبی ماحولیاتی نظام میں ماحولیاتی طاقوں کی ایک حد پر قابض ہے۔ وہ ان ماحولیاتی نظاموں میں بنیادی پروڈیوسر اور بنیادی صارفین دونوں ہیں اور زندگی کے لیے ضروری عناصر (مثلاً کاربن اور نائٹروجن) کی عالمی بائیو کیمیکل سائیکلنگ چلاتے ہیں۔ بیکٹیریوپلانکٹن کی بہت سی انواع آٹوٹروفک ہوتی ہیں، اور وہ فوٹو سنتھیس یا کیموسینتھیس سے توانائی حاصل کرتی ہیں۔ فوٹو سنتھیٹک بیکٹیریوپلانکٹن کو اکثر picophytoplankton کے طور پر درجہ بندی کیا جاتا ہے، اور اس میں بڑے cyanobacterial گروپس جیسے Prochlorococcus اور Synechococcus شامل ہیں۔ دیگر heterotrophic bacterioplankton saprotrophic ہیں، اور دوسرے جانداروں کے ذریعہ تیار کردہ نامیاتی مواد استعمال کرکے توانائی حاصل کرتے ہیں۔ یہ مواد درمیانے درجے میں تحلیل ہو سکتا ہے اور وہاں سے براہ راست لیا جا سکتا ہے، یا بیکٹیریا سمندری برف جیسے ذرات کے مواد کے ساتھ مل کر زندہ اور بڑھ سکتے ہیں۔ بیکٹیریوپلانکٹن عالمی نائٹروجن فکسیشن، نائٹریفیکیشن، ڈینیٹریفیکیشن، ری مینرلائزیشن اور میتھانوجینیسیس میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ بیکٹیریاپلانکٹن کی کثرت کا انحصار ماحولیاتی تغیرات جیسے درجہ حرارت، غذائی اجزاء کی دستیابی اور شکار پر ہے۔ دوسرے چھوٹے پلانکٹن کی طرح، بیکٹیریوپلانکٹن کا شکار زوپلانکٹن (عام طور پر پروٹوزوآنز) کرتے ہیں، اور ان کی تعداد کو بھی بیکٹیریوفیجز کے ذریعے انفیکشن کے ذریعے کنٹرول کیا جاتا ہے۔
بیکٹیریوپلانکٹن_کاؤنٹنگ_میتھڈز/بیکٹریوپلانکٹن گنتی کے طریقے:
بیکٹیریوپلانکٹن کی گنتی پانی کے ایک مخصوص جسم میں بیکٹیریاپلانکٹن کی کثرت کا اندازہ ہے، جو سمندری مائکرو بایولوجسٹ کے لیے مفید معلومات ہے۔ مشاہدہ کیے جانے والے پانی میں موجود تعداد کا تعین کرنے کے لیے کئی سالوں میں گنتی کے مختلف طریقے تیار کیے گئے ہیں۔ بیکٹیریوپلانکٹن کی گنتی کے لیے استعمال کیے جانے والے طریقوں میں ایپی فلوروسینس مائیکروسکوپی، فلو سائٹومیٹری، تقسیم کرنے والے خلیوں کی فریکوئنسی (FDC) کے ذریعے پیداواری صلاحیت کے اقدامات، تھائمائیڈائن انکارپوریشن، اور لیوسین کارپوریشن شامل ہیں۔ نمکیات، درجہ حرارت، عرض بلد، مختلف غذائی اجزاء، پانی کی نقل و حرکت اور دیگر جانداروں کی موجودگی جیسے عوامل بیکٹیریوپلانکٹن کی گنتی کو متاثر کر سکتے ہیں۔ ان عوامل میں تبدیلیاں بیکٹیریوپلانکٹن کی گنتی کو متاثر کرتی ہیں، جس کی وجہ سے یہ پانی کے جسم، مقام، ساحل سے فاصلے اور موسم کے لحاظ سے مختلف ہوتا ہے۔ بیکٹیریوپلانکٹن کی گنتی عام طور پر فی ملی لیٹر (خلیات ml−1) میں ظاہر ہوتی ہے۔
بیکٹیریوپلانائیڈز/بیکٹریوپلانائیڈز:
بیکٹیریوپلانوائڈس ایک بیکٹیریا جینس ہے جو Oceanospirillaceae کے خاندان سے ہے جس میں ایک معلوم نوع (Bacterioplanoides pacificum) ہے۔
بیکٹیریوپلانوائیڈز پیسفکم
بیکٹیریوپلانوائیڈز پیسیفکم ایک گرام منفی، سختی سے ایروبک اور متحرک بیکٹیریم ہے جو بیکٹیریوپلانائیڈز کی نسل سے ایک واحد قطبی فلیجیلم کے ساتھ ہے جسے جنوبی بحر الکاہل کے گائر سے الگ تھلگ کیا گیا ہے۔
بیکٹیریا ہوڈوپسن
Bacteriorhodopsin ایک پروٹین ہے جو Archaea کے ذریعے استعمال کیا جاتا ہے، خاص طور پر haloarchaea، Euryarchaeota کی ایک کلاس۔ یہ ایک پروٹون پمپ کے طور پر کام کرتا ہے؛ یعنی یہ ہلکی توانائی حاصل کرتا ہے اور اسے سیل سے باہر جھلی کے پار پروٹون کو منتقل کرنے کے لیے استعمال کرتا ہے۔ نتیجے میں پروٹون گریڈینٹ بعد میں کیمیائی توانائی میں تبدیل ہو جاتا ہے۔
Bacteriostatic_agent/Bacteriostatic agent:
ایک بیکٹیریاسٹیٹک ایجنٹ یا بیکٹیریوسٹیٹ، مختصراً Bstatic، ایک حیاتیاتی یا کیمیائی ایجنٹ ہے جو بیکٹیریا کو دوبارہ پیدا ہونے سے روکتا ہے، جبکہ ضروری نہیں کہ وہ انہیں مار ڈالیں۔ ان کی درخواست پر منحصر ہے، بیکٹیریاسٹیٹک اینٹی بائیوٹکس، جراثیم کش ادویات، جراثیم کش ادویات اور محافظوں میں فرق کیا جا سکتا ہے۔ جب بیکٹیریاسٹیٹک antimicrobials استعمال کیے جاتے ہیں، تو تھراپی کا دورانیہ کافی ہونا چاہیے تاکہ میزبان دفاعی میکانزم کو بیکٹیریا کا خاتمہ کر سکے۔ بیکٹیریاسٹیٹ کو ہٹانے پر، بیکٹیریا عام طور پر تیزی سے بڑھنے لگتے ہیں۔ یہ جراثیم کش ادویات کے برعکس ہے، جو بیکٹیریا کو مارتے ہیں۔ بیکٹیریا سٹیٹس کو اکثر سطحوں پر بیکٹیریا کی افزائش کو روکنے کے لیے پلاسٹک میں استعمال کیا جاتا ہے۔ عام طور پر لیبارٹری کے کام میں استعمال ہونے والے بیکٹیریوسٹٹس میں سوڈیم ایزائیڈ (جو کہ شدید زہریلا ہے) اور تھیومرسل شامل ہیں۔
بیکٹیریوتھراپی/بیکٹریوتھراپی:
بیکٹیریا تھراپی ایک بیماری کے علاج میں بیکٹیریا یا ان کی مصنوعات کا بامقصد استعمال ہے۔ بیکٹیریا تھراپی کی شکلوں میں پروبائیوٹکس کا استعمال شامل ہے، مائکروجنزم جو استعمال کرتے وقت صحت کے فوائد فراہم کرتے ہیں۔ فیکل میٹر ٹرانسپلانٹس (FMT) / آنتوں کے مائکرو بائیوٹا ٹرانسپلانٹ (IMT)، مائیکرو بائیوٹا کو بحال کرنے کے لیے صحت مند عطیہ دہندگان کے فیکل مادے سے وصول کنندہ مریضوں میں گٹ مائکروجنزموں کی منتقلی؛ یا synbiotics جو prebiotics، نا ہضم اجزاء جو فائدہ مند مائکروجنزموں کی افزائش کو فروغ دیتے ہیں، اور پروبائیوٹکس کو یکجا کرتے ہیں۔ ان طریقوں کے ذریعے، گٹ مائیکرو بائیوٹا، 300-500 مائکروجنزم پرجاتیوں کی کمیونٹی جو جانوروں کے ہاضمے میں رہتی ہے جو عمل انہضام، توانائی کے ذخیرہ کرنے، مدافعتی افعال اور پیتھوجینز کے خلاف تحفظ میں مدد کرتی ہے، کو سازگار بیکٹیریا کے ساتھ دوبارہ آباد کیا جا سکتا ہے، جس کے نتیجے میں علاج معالجے میں مدد ملتی ہے۔ ایف ایم ٹی کو سی ڈِف انفیکشنز کے لیے ایک نئے اور موثر علاج کے طور پر استعمال کیا جا رہا ہے، ایک معدے کی بیماری جس میں کلوسٹریڈیم ڈفِسائل ایک جاندار کے گٹ کو کالونائز کرتا ہے جو مائکروبیل توازن میں خلل ڈالتا ہے اور اسہال کا باعث بنتا ہے جو ممکنہ طور پر جان لیوا ہو سکتا ہے۔ ڈپریشن، پریشانی اور آٹزم سپیکٹرم ڈس آرڈر جیسے دماغی امراض کے علاج میں بھی بیکٹیریو تھراپی کا استعمال شروع ہو گیا ہے۔ گٹ کے پودوں کی بحالی کو دماغی عوارض کے علاج میں مؤثر طریقے سے استعمال کیا جا سکتا ہے کیونکہ گٹ برین محور، دماغ اور آنتوں کے درمیان رابطے کا دو طرفہ راستہ، خاص طور پر گٹ مائکروبیوٹا۔
Bacteriovoracaceae/Bacteriovoracaceae:
Bacteriovoracaceae گرام منفی، کوما کی شکل والے بیکٹیریا کا ایک خاندان ہے۔ تمام ممبران کا دو حصوں کا لائف سائیکل ہوتا ہے جس میں ایک آزاد زندہ متحرک "حملہ کا مرحلہ" اور ایک "شکاری مرحلہ" ہوتا ہے جو دوسرے گرام منفی بیکٹیریا کے پیری پلاسم میں رہتا ہے۔ Bacteriovoracaceae میٹھے پانی اور مٹی میں پائے جاتے ہیں۔
بیکٹیریوووراکالس/بیکٹیریوووراکالس:
بیکٹیریوووراکالس بیکٹیریا کا ایک حکم ہے۔
بیکٹیریوووریکس/بیکٹیریووورکس:
بیکٹیریووریکس ایک جینس ہے جس میں بیکٹیریووراکاسی، بیکٹیریوووراکس سٹولپی خاندان میں بیکٹیریم کی ایک ہی نوع ہوتی ہے۔ یہ ایک شکاری ہے جو بڑے گرام منفی بیکٹیریا کو کھاتا ہے۔ یہ شکار کرنے والے بیکٹیریا اندرونی ماحول میں رہتے ہیں اور اسی طرح کے لیپوپولیسیکرائڈ ڈھانچے رکھتے ہیں۔ Bacteriovorax stolpii اپنے شکار کو بیرونی جھلی کے پروٹین ریسیپٹرز کے ذریعے پہچانتا ہے، جو بتاتا ہے کہ کیوں گرام پازیٹو بیکٹیریا جن میں بیرونی جھلیوں کی کمی ہوتی ہے وہ شکار کے طور پر کام نہیں کرتے۔ وہ انٹرپیریپلاسمک جگہ پر حملہ کرکے بیکٹیریا کا شکار کرتے ہیں جہاں وہ کھانا کھاتے ہیں، بڑھتے ہیں اور دوبارہ پیدا کرتے ہیں۔ بیکٹیریوووریکس سٹولپی کو اسی طرح کی شکلوں اور طرز زندگی کی خصوصیات کی وجہ سے Bdellovibrio نسل میں درجہ بندی کیا جاتا تھا، تاہم انہیں فائیلوجینیٹک تجزیہ کے ذریعے ایک نئی نسل کے طور پر تسلیم کیا گیا۔
بیکٹیریم_(ضد ابہام)/بیکٹیریم (ضد ابہام):
بیکٹیریم سے رجوع ہوسکتا ہے: بیکٹیریا کی واحد شکل بیکٹیریم (جینس) بیکٹیریم (فلم)، 2006 کی فلم
بیکٹیریم_(جینس)/بیکٹیریم (جینس):
جینس بیکٹیریم ایک ٹیکسن تھا جسے 1828 میں کرسچن گوٹ فرائیڈ ایہرنبرگ نے بیان کیا تھا۔ اس قسم کی انواع کو بعد میں بیکٹیریم ٹرائیلوکولر سے بیکٹیریم کولی (اب ایسچریچیا کولی) میں تبدیل کر دیا گیا کیونکہ یہ ختم ہو گئی تھی۔ 1951 میں اور پھر 1954 میں اسے ایک نام generum rejiciendum کے طور پر تسلیم کیا گیا، جس کا مطلب ہے ایک عام نام جسے مسترد کر دیا جائے؛ یہ اس کے خاندان Bacteriaceae پر بھی لاگو ہوتا ہے۔ اس جینس میں غیر بیضوی بنانے والی سلاخیں شامل تھیں جن کا دیگر پرجاتیوں سے تعلق غیر واضح تھا (ایک "ٹیکسونومی ڈمپنگ گروپ")۔ یہ جینس بیسیلس سے مختلف ہے، جس کے ارکان بیضہ بنانے والی سلاخیں تھے (سینسو کوہن 1872)۔